269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0105 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  100 
 
 
157 aa  318  3e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  58.6 
 
 
160 aa  181  3e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  56.05 
 
 
158 aa  174  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  52.7 
 
 
158 aa  158  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 
161 aa  136  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  40.79 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  44.44 
 
 
161 aa  134  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  43.87 
 
 
157 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  42.86 
 
 
156 aa  133  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  40.76 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 
162 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  44.16 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  44.87 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  42.86 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  44.16 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  42.21 
 
 
158 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  42.86 
 
 
158 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  42.86 
 
 
158 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  42.21 
 
 
158 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  42.21 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  42.86 
 
 
158 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  42.68 
 
 
161 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  42.86 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  43.42 
 
 
161 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  40.82 
 
 
169 aa  120  7e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  43.33 
 
 
161 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  39.61 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  38.96 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  40.91 
 
 
158 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  37.82 
 
 
158 aa  107  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  39.22 
 
 
164 aa  105  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  39.61 
 
 
156 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  40 
 
 
161 aa  100  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  39.44 
 
 
156 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  35.86 
 
 
160 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  35.86 
 
 
160 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  39.44 
 
 
156 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  36.77 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  33.99 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  36.77 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  37.25 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  36.77 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  36.36 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.97 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.26 
 
 
161 aa  94  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 
170 aa  94  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  38.06 
 
 
155 aa  94  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  36.31 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  38.31 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  37.01 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  40.16 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.66 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  36.18 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  45.63 
 
 
112 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  36.88 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  35.22 
 
 
162 aa  91.7  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  35.9 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  36.08 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  33.79 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  34.39 
 
 
160 aa  90.9  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  35.9 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  35.9 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  35.9 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  35.9 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  35.9 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  35.22 
 
 
162 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  32.47 
 
 
169 aa  90.9  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  35.9 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  38.31 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  35.9 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  35.21 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  30.97 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  38.85 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  38.85 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  37.01 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  38.85 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  37.01 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  36.94 
 
 
155 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  34.62 
 
 
159 aa  89  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  32.69 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1441  ybaK/ebsC protein  37.06 
 
 
162 aa  87.4  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  38.85 
 
 
158 aa  87.4  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  31.76 
 
 
168 aa  87  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  37.66 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  33.77 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  36.89 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  32.5 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  35 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  35.26 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  32.89 
 
 
155 aa  84.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  35.48 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  33.97 
 
 
159 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  33.97 
 
 
159 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  33.97 
 
 
159 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  33.97 
 
 
159 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>