More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0098 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0098  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
131 aa  264  4e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.578211  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1763  30S ribosomal protein S8  83.97 
 
 
131 aa  230  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00017341  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0048  30S ribosomal protein S8  81.68 
 
 
131 aa  224  3e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.580266  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0073  30S ribosomal protein S8  73.28 
 
 
131 aa  206  6e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.200652  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1690  30S ribosomal protein S8  72.52 
 
 
131 aa  204  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0798562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1861  30S ribosomal protein S8  71.76 
 
 
131 aa  203  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2067  30S ribosomal protein S8  70.99 
 
 
131 aa  200  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1954  ribosomal protein S8  67.18 
 
 
131 aa  196  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1019  30S ribosomal protein S8  78.95 
 
 
114 aa  194  3e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000503612  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0300  30S ribosomal protein S8  67.94 
 
 
131 aa  185  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.110485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
132 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.5487e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  44.62 
 
 
132 aa  121  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
132 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  45.38 
 
 
134 aa  119  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  42.75 
 
 
131 aa  119  1e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  4.55878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  42.75 
 
 
131 aa  119  2e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  2.83482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
131 aa  119  2e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  45.38 
 
 
132 aa  118  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.76447e-06  hitchhiker  1.37084e-07 
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  41.98 
 
 
131 aa  117  5e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  7.1854e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
131 aa  117  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
132 aa  117  8e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  3.37802e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  42.75 
 
 
132 aa  117  8e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  4.78289e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2282  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  116  1e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  2.28338e-08  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  115  1e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.99724e-13  hitchhiker  3.61155e-08 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  44.27 
 
 
134 aa  116  1e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0503  30S ribosomal protein S8  45.24 
 
 
132 aa  115  2e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  114  4e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2215  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 
131 aa  114  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.86287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79299e-11 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  41.54 
 
 
132 aa  113  7e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0303  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 
131 aa  113  7e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  41.98 
 
 
132 aa  113  8e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  7.64714e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  112  1e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  112  2e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  41.22 
 
 
131 aa  112  2e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2409  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
131 aa  112  2e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  43.18 
 
 
132 aa  112  2e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  6.49182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  40.77 
 
 
132 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  42.75 
 
 
133 aa  111  4e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  7.26812e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  41.54 
 
 
133 aa  111  4e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  111  4e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1837  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
131 aa  111  4e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247256  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 
130 aa  110  7e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0773  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
132 aa  110  8e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590694  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  42.75 
 
 
133 aa  110  8e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0195  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
131 aa  110  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.344258  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  41.54 
 
 
132 aa  109  1e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  1.36856e-05 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2050  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 
131 aa  109  1e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00419842  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0605  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
130 aa  109  1e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354431  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  109  1e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  6.86706e-07  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1840  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
133 aa  108  2e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  40.77 
 
 
132 aa  108  2e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  41.22 
 
 
131 aa  109  2e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
131 aa  108  2e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  42.75 
 
 
133 aa  108  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  39.23 
 
 
132 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0566  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
132 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
132 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
132 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  40.77 
 
 
130 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
132 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4357  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 
132 aa  107  4e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  3.70382e-07  normal  0.0738718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
133 aa  107  4e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  41.54 
 
 
132 aa  107  4e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  6.31247e-05 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2605  30S ribosomal protein S8  40.46 
 
 
131 aa  107  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  2.06402e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  38.17 
 
 
132 aa  107  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  4.38805e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0861  SSU ribosomal protein S8P  47.33 
 
 
132 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118067  hitchhiker  0.00176948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4534  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
130 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000327382  normal  0.123392 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0682  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 
129 aa  107  5e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0640  ribosomal protein S8  43.08 
 
 
130 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  3.05932e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0351  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
130 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.94247e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5065  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
130 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  4.51262e-14  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2155  ribosomal protein S8  41.98 
 
 
130 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0746711  normal  0.328935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4784  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 
132 aa  107  7e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00859793  hitchhiker  6.7379e-09 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  45.86 
 
 
132 aa  107  7e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1368  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
132 aa  107  7e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380373  normal  0.0838424 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1404  ribosomal protein S8  39.53 
 
 
130 aa  107  7e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  40 
 
 
130 aa  107  8e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1628  30S ribosomal protein S8  43.51 
 
 
132 aa  106  9e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569201  normal  0.282916 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  43.94 
 
 
133 aa  106  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2893  ribosomal protein S8  38.93 
 
 
131 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2204  ribosomal protein S8  43.18 
 
 
131 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184093  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  38.17 
 
 
132 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  4.96692e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2760  30S ribosomal protein S8  46.88 
 
 
127 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000679663  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1853  30S ribosomal protein S8  38.35 
 
 
133 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.923356 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  41.79 
 
 
134 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  39.23 
 
 
132 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 
129 aa  105  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  40.46 
 
 
132 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  9.78378e-10  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
131 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.52194e-15  unclonable  4.69297e-08 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  37.4 
 
 
132 aa  105  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0268  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
130 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0501606  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
131 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0435  SSU ribosomal protein S8P  42.31 
 
 
130 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0495353  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2150  ribosomal protein S8  42.42 
 
 
131 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  40.77 
 
 
133 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  42.42 
 
 
132 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  41.35 
 
 
135 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>