More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0093 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0093  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
83 aa  166  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1959  30S ribosomal protein S17  78.31 
 
 
83 aa  142  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.493665  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0043  30S ribosomal protein S17  83.95 
 
 
85 aa  141  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.183118  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1024  30S ribosomal protein S17  79.52 
 
 
83 aa  138  2e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00110885  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1768  30S ribosomal protein S17  79.52 
 
 
83 aa  139  2e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000123557  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1695  30S ribosomal protein S17  74.7 
 
 
83 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000812231  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1866  30S ribosomal protein S17  74.7 
 
 
83 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0068  30S ribosomal protein S17  71.08 
 
 
83 aa  132  2e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00143996  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2072  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 
83 aa  131  4e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0741725  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0295  30S ribosomal protein S17  70.51 
 
 
82 aa  117  4e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  45.33 
 
 
87 aa  78.6  3e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  48.57 
 
 
138 aa  78.2  4e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  49.32 
 
 
90 aa  77.4  5e-14  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  50.67 
 
 
86 aa  77.4  6e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  46.15 
 
 
91 aa  77.4  6e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  2.46265e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  46.15 
 
 
91 aa  77.4  6e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
97 aa  76.3  1e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 
92 aa  75.5  2e-13  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  44.74 
 
 
82 aa  75.5  2e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  47.37 
 
 
101 aa  75.9  2e-13  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  8.54587e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 
88 aa  75.1  3e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  47.37 
 
 
87 aa  75.1  3e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 
88 aa  75.1  3e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
86 aa  75.5  3e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  50.7 
 
 
85 aa  74.7  4e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 
88 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  2.64542e-06 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1842  30S ribosomal protein S17  47.37 
 
 
89 aa  74.7  4e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0587769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 
88 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  4.77154e-05  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  50.7 
 
 
84 aa  74.3  5e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  43.21 
 
 
85 aa  74.3  5e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
94 aa  73.9  8e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2160  30S ribosomal protein S17  46.67 
 
 
88 aa  73.2  1e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0103749  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  49.37 
 
 
85 aa  73.2  1e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  46.58 
 
 
86 aa  72.8  2e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
120 aa  72  3e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  71.2  4e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
89 aa  71.2  5e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  2.78806e-05  hitchhiker  1.99578e-06 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
89 aa  71.2  5e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  1.015e-05  hitchhiker  3.62348e-06 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  43.21 
 
 
88 aa  70.9  6e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  4.32201e-08 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
88 aa  70.9  6e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  70.9  6e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.5859e-13  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
88 aa  70.9  6e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
89 aa  70.5  7e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 
76 aa  70.5  8e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  47.37 
 
 
84 aa  70.1  9e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.5143e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2287  30S ribosomal protein S17  47.89 
 
 
89 aa  70.1  9e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.32809e-08  hitchhiker  0.00277508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 
88 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  43.42 
 
 
107 aa  70.1  1e-11  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  6.54359e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
89 aa  70.1  1e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  7.40755e-07  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  47.37 
 
 
84 aa  70.1  1e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  44 
 
 
86 aa  69.7  1e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  45.57 
 
 
88 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  2.69745e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  43.59 
 
 
96 aa  68.9  2e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  51.43 
 
 
88 aa  69.3  2e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  47.22 
 
 
88 aa  69.3  2e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  3.37654e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  47.83 
 
 
83 aa  68.9  2e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.49571e-05  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  40.26 
 
 
94 aa  68.9  2e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  43.75 
 
 
92 aa  68.9  2e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.82432e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  45.95 
 
 
88 aa  68.9  2e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.52405e-29 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  47.89 
 
 
89 aa  69.3  2e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 
120 aa  69.3  2e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0304  ribosomal protein S17  36.99 
 
 
87 aa  68.9  2e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000983019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  43.24 
 
 
82 aa  68.6  3e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  8.64007e-09  unclonable  1.12365e-08 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
92 aa  68.6  3e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  1.75324e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  44.44 
 
 
85 aa  68.6  3e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78242e-12 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
93 aa  68.6  3e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
99 aa  68.6  3e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  48.57 
 
 
88 aa  68.6  3e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  9.38527e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  43.24 
 
 
82 aa  68.6  3e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.14051e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
87 aa  68.6  3e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  1.86006e-11  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
84 aa  68.2  4e-11  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 
87 aa  68.2  4e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  43.42 
 
 
110 aa  68.2  4e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  43.75 
 
 
90 aa  68.2  4e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  44.44 
 
 
85 aa  68.2  4e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  43.24 
 
 
82 aa  67.8  4e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  3.50413e-08  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 
79 aa  67.8  5e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  47.56 
 
 
89 aa  67.8  5e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  47.56 
 
 
89 aa  67.8  5e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  2.77089e-08 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 
79 aa  67.8  5e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
87 aa  67.8  5e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  47.3 
 
 
94 aa  67.8  6e-11  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
85 aa  67  7e-11  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  41.89 
 
 
82 aa  67.4  7e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.15651e-08  unclonable  4.30661e-11 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 
85 aa  67.4  7e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 
88 aa  67  8e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  44.29 
 
 
83 aa  67  8e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  45.71 
 
 
88 aa  67  9e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  42.5 
 
 
90 aa  67  9e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  41.25 
 
 
90 aa  67  9e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  4.05514e-09  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  43.59 
 
 
84 aa  67  9e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  8.73863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  45.07 
 
 
87 aa  67  9e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  41.25 
 
 
90 aa  67  9e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  1.37406e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  48.65 
 
 
87 aa  66.6  1e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.89804e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
86 aa  66.2  1e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  42.5 
 
 
90 aa  66.6  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  42.5 
 
 
90 aa  66.6  1e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  43.06 
 
 
88 aa  66.6  1e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.43276e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  44.93 
 
 
97 aa  66.6  1e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  1.73593e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  42.5 
 
 
90 aa  66.6  1e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>