58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0092 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0092  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 61 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.786092  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1769  50S ribosomal protein L29  75.41 
 
 		 64 aa  92.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000104669  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1867  50S ribosomal protein L29  77.97 
 
 		 61 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1696  50S ribosomal protein L29  77.97 
 
 		 61 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00133107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2073  50S ribosomal protein L29  77.97 
 
 		 61 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0466832  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0067  50S ribosomal protein L29  73.77 
 
 		 61 aa  88.2  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1025  50S ribosomal protein L29  73.77 
 
 		 61 aa  87.8  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00341949  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0042  50S ribosomal protein L29  70.49 
 
 		 61 aa  86.3  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118761  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1960  ribosomal protein L29  71.19 
 
 		 62 aa  84  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.430573  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0294  50S ribosomal protein L29  54.1 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00124097  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0434  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157908  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0492  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000269132  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0497  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000428226  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  50.91 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  47.27 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  42.37 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  47.06 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  49.09 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  42.37 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0287  50S ribosomal protein L29P  38.6 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866901  hitchhiker  0.00000164935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3516  ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000165704  hitchhiker  0.00000095159 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  47.06 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  43.4 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  42.31 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0327  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.65874e-22  unclonable  0.0000000398692 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  42.37 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  39.34 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 62 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 68 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>