More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0088 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0088  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
93 aa  189  8e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106882  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1871  30S ribosomal protein S19  90.32 
 
 
93 aa  178  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2077  30S ribosomal protein S19  90.32 
 
 
93 aa  178  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  3.62901e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1700  30S ribosomal protein S19  90.32 
 
 
93 aa  178  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  1.07992e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  90.32 
 
 
93 aa  177  6e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  1.50625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0038  30S ribosomal protein S19  87.1 
 
 
93 aa  171  2e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0039169  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0063  30S ribosomal protein S19  87.1 
 
 
93 aa  171  3e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000375737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1964  ribosomal protein S19  80.65 
 
 
93 aa  164  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0147162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
91 aa  151  3e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  129  1e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
90 aa  128  2e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.59778e-07  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  66.28 
 
 
89 aa  127  4e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
91 aa  126  8e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  7.61945e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
93 aa  126  1e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  66.28 
 
 
93 aa  125  1e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  66.27 
 
 
93 aa  125  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.03026e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  73.49 
 
 
93 aa  125  2e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  125  2e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  4.53521e-06  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
91 aa  124  4e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  7.24937e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  124  4e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  4.3477e-06  hitchhiker  6.13779e-06 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  124  4e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  1.16532e-07 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  61.29 
 
 
94 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  2.07611e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.48079e-06  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  4.90482e-09  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  8.04319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.90611e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  2.95141e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  4.03295e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  4.07777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  4.42981e-11  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  6.94495e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  9.27803e-08  hitchhiker  1.50693e-11 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.65315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0398  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  8e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0373  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  8e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  123  8e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  2.18247e-06  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  5.05191e-06  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
91 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
91 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.70652e-15  unclonable  3.67695e-08 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
93 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.77682e-06  hitchhiker  1.20384e-09 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
93 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  120  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  7.16821e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  65.12 
 
 
95 aa  120  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
91 aa  120  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22685e-06 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  62.65 
 
 
90 aa  120  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.62124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  120  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.02796e-06  unclonable  7.23515e-06 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  6.56503e-09 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  120  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  2.02257e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  63.33 
 
 
90 aa  120  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  63.86 
 
 
91 aa  120  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  6.07565e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.00624e-06  unclonable  5.33461e-12 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  62.37 
 
 
92 aa  119  1e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  1.30645e-14  hitchhiker  4.79919e-20 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.08032e-09  hitchhiker  1.25391e-09 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.2398e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  1.51604e-08 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.56834e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.85402e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.60903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.19443e-05  unclonable  1.54128e-11 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  119  1e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.52177e-06  unclonable  4.39739e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.47318e-05  unclonable  8.36266e-06 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  62.37 
 
 
92 aa  119  1e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  6.98135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  66.27 
 
 
91 aa  119  1e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.9413e-08  hitchhiker  1.61799e-06 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
91 aa  119  1e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  9.87549e-06  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  119  1e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.86112e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  118  2e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
90 aa  119  2e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
92 aa  118  2e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.28304e-05  decreased coverage  4.75067e-05 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
91 aa  119  2e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.91736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  119  2e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  4.77876e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
92 aa  118  2e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.19027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
91 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.53887e-05  unclonable  3.38266e-12 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  62.65 
 
 
92 aa  118  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0501  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
91 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.245723  hitchhiker  2.73947e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0331  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
91 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.782912  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  65.06 
 
 
92 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.20584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2170  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
92 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.3951e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  117  4e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
88 aa  117  4e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  117  4e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
87 aa  117  4e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
92 aa  117  5e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03118  hypothetical protein  62.65 
 
 
92 aa  117  5e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00218529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
92 aa  117  5e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03167  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
92 aa  117  5e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00168585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3701  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
92 aa  117  5e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.04541e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3611  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
92 aa  117  5e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.98162e-05  normal  0.0138376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4639  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
92 aa  117  5e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0583942  normal  0.0837365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3510  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
92 aa  117  5e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.24405e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>