More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0087 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0087  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
276 aa  560  1e-159  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.025242  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  84.78 
 
 
276 aa  491  1e-138  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1029  50S ribosomal protein L2  84.12 
 
 
277 aa  478  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000494173  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0352  50S ribosomal protein L2  83.75 
 
 
277 aa  476  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  1.47687e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0062  50S ribosomal protein L2  81.16 
 
 
276 aa  468  1e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.24196e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1701  50S ribosomal protein L2  80.07 
 
 
276 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  3.71548e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1872  50S ribosomal protein L2  80.43 
 
 
276 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.701919  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2078  50S ribosomal protein L2  80.8 
 
 
276 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  4.77294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1965  ribosomal protein L2  80.07 
 
 
276 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000977898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0289  50S ribosomal protein L2  73.36 
 
 
279 aa  420  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 
277 aa  344  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  62.09 
 
 
276 aa  338  4e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  1.65173e-06 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  61.59 
 
 
276 aa  338  6e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  5.61637e-06  decreased coverage  1.03379e-08 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  61.23 
 
 
276 aa  333  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  63 
 
 
274 aa  327  2e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.47453e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 
275 aa  327  2e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 
275 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
275 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  57.88 
 
 
274 aa  322  5e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  60 
 
 
276 aa  322  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 
276 aa  321  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  57.91 
 
 
278 aa  321  7e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.62145e-06  hitchhiker  6.63071e-07 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 
274 aa  321  7e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  60.79 
 
 
277 aa  320  2e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 
276 aa  319  2e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.90971e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 
279 aa  320  2e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 
273 aa  319  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.50454e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
276 aa  319  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 
274 aa  319  4e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 
276 aa  318  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  60.74 
 
 
274 aa  317  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.33663e-07  hitchhiker  8.56838e-12 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  59.5 
 
 
277 aa  316  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 
275 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.5035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  61.51 
 
 
277 aa  316  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  60 
 
 
279 aa  315  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 
277 aa  315  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  1.30499e-05 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  59.21 
 
 
276 aa  313  1e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.04251e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
276 aa  313  1e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
276 aa  313  1e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.00516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
276 aa  313  1e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
276 aa  313  1e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  5.12601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
276 aa  313  1e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.00839e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
276 aa  313  1e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38046e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
276 aa  313  1e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.01221e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  59.21 
 
 
276 aa  313  2e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.87869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 
274 aa  312  3e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.4248e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
274 aa  313  3e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
276 aa  312  5e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.80933e-09  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
276 aa  312  5e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.49417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 
274 aa  312  5e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29312e-15 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 
277 aa  311  6e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.99614e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 
277 aa  311  6e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.90927e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  58.63 
 
 
277 aa  311  8e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 
276 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  58.76 
 
 
274 aa  310  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 
275 aa  309  3e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  57.19 
 
 
277 aa  308  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  57.19 
 
 
277 aa  308  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  57.61 
 
 
275 aa  308  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 
276 aa  308  6e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  58.03 
 
 
273 aa  308  7e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  58.03 
 
 
273 aa  308  7e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 
276 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.10614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 
274 aa  305  4e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  58.39 
 
 
273 aa  305  5e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 
276 aa  305  6e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  57.56 
 
 
279 aa  305  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2616  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 
275 aa  304  1e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0160883  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  55.64 
 
 
275 aa  303  2e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 
276 aa  303  2e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3992  ribosomal protein L2  56.73 
 
 
275 aa  303  2e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00448  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
274 aa  301  6e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0129739  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 
278 aa  301  6e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  3.4721e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  58.99 
 
 
281 aa  300  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  3.49234e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  55.47 
 
 
275 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 
275 aa  299  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  57.66 
 
 
275 aa  299  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 
287 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  56.04 
 
 
275 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  7.64843e-09  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  56.04 
 
 
275 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  4.14315e-06  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  56.04 
 
 
275 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  5.85498e-10  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  56.04 
 
 
275 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  56.04 
 
 
275 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  1.62377e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  56 
 
 
275 aa  298  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  55.68 
 
 
275 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.23883e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0963  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 
275 aa  298  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00625904  hitchhiker  1.61737e-06 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  56.41 
 
 
275 aa  298  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  1.21783e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 
275 aa  298  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  56.04 
 
 
275 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  3.26026e-05  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  58.03 
 
 
276 aa  297  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2166  ribosomal protein L2  54.01 
 
 
273 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000491264  normal  0.227842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  55.11 
 
 
275 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  6.88583e-06 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  56.47 
 
 
280 aa  296  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 
276 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 
276 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3335  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 
275 aa  295  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  6.45842e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1357  50S ribosomal protein L2  56.68 
 
 
279 aa  295  7e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.184496  normal  0.0354969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  56.23 
 
 
279 aa  295  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  58.06 
 
 
282 aa  294  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  59.29 
 
 
279 aa  294  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.64134e-06  normal  0.142265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>