124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0086 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0086  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
93 aa  187  5e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00130927  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1873  50S ribosomal protein L23  84.95 
 
 
93 aa  161  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0703084  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2079  50S ribosomal protein L23  84.95 
 
 
93 aa  160  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  1.38255e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1702  50S ribosomal protein L23  84.95 
 
 
93 aa  160  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  4.96686e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0036  50S ribosomal protein L23  82.22 
 
 
93 aa  154  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00020756  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0353  50S ribosomal protein L23  79.57 
 
 
93 aa  152  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  1.9966e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0061  50S ribosomal protein L23  78.49 
 
 
93 aa  151  3e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  4.83414e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1030  50S ribosomal protein L23  80.65 
 
 
93 aa  150  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000430849  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1966  50S ribosomal protein L23  73.12 
 
 
93 aa  138  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  8.55171e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0288  50S ribosomal protein L23  63.04 
 
 
93 aa  127  4e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00767163  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  42.7 
 
 
113 aa  60.8  6e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 
98 aa  59.3  2e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
111 aa  57.8  5e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  31.33 
 
 
97 aa  56.6  1e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.79883e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 
98 aa  56.2  1e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  39.24 
 
 
98 aa  55.1  3e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
100 aa  55.1  3e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 
97 aa  54.3  6e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  35.9 
 
 
99 aa  53.9  7e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  1.56644e-07  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 
104 aa  53.9  7e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 
97 aa  53.9  8e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 
97 aa  53.9  8e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 
98 aa  53.9  8e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  35.8 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 
98 aa  53.5  1e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 
98 aa  52.4  2e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  38.96 
 
 
97 aa  52.8  2e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  51.2  4e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  8.0861e-06  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  51.2  4e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.49996e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  51.2  4e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.92959e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  51.2  4e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.25733e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  51.2  4e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  51.2  4e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  35.14 
 
 
100 aa  51.2  4e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  51.2  4e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.47098e-06  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  35.14 
 
 
100 aa  51.2  4e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.25919e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 
97 aa  50.8  6e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 
97 aa  50.8  6e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  33.78 
 
 
100 aa  50.8  6e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.72317e-09  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  35.44 
 
 
96 aa  50.8  6e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  50.8  7e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  7.93915e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  50.8  7e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  50.8  7e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.8697e-06  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  50.8  7e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  50.8  7e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  50.8  7e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  34.18 
 
 
102 aa  50.4  8e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  34.94 
 
 
98 aa  49.7  1e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04519  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
99 aa  49.7  1e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  2.51996e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  33.78 
 
 
100 aa  49.3  2e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  32.43 
 
 
100 aa  49.3  2e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.08369e-09  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  32.43 
 
 
100 aa  49.3  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  32.43 
 
 
100 aa  49.3  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.48684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 
100 aa  48.5  3e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  32.43 
 
 
100 aa  48.5  3e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.18373e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  32.91 
 
 
98 aa  48.5  3e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3820  50S ribosomal protein L23  32.43 
 
 
100 aa  48.1  4e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.60172e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3999  50S ribosomal protein L23  32.43 
 
 
100 aa  48.1  4e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  1.01961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  35.44 
 
 
95 aa  47.8  5e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
100 aa  47.8  5e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  32.95 
 
 
95 aa  47.8  6e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
101 aa  47.4  7e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
101 aa  47.4  7e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  6.98801e-06  unclonable  1.84888e-11 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  35.96 
 
 
94 aa  47.4  7e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  32.05 
 
 
99 aa  47.4  8e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  4.57129e-06  hitchhiker  6.22944e-06 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  35.06 
 
 
97 aa  47  9e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  34.52 
 
 
94 aa  47  9e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.28479e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.18285e-09  hitchhiker  1.27878e-09 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.282e-06  unclonable  5.66696e-12 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.2639e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.95974e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  34.67 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.42276e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  34.67 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.43862e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  1.15816e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.63544e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.51497e-07  unclonable  7.70372e-06 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  32.47 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  35.06 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.67938e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0486  50S ribosomal protein L23  34.57 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  9.45976e-07  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0491  50S ribosomal protein L23  34.57 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  3.10283e-09  hitchhiker  0.00323784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  35.71 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  35.06 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0330  ribosomal protein L23  33.78 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  35.06 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  32.93 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  32.05 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.57762e-07  unclonable  6.93674e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.47106e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  34.09 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4315  50S ribosomal protein L23  32.05 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.09174e-06  unclonable  5.39649e-11 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.31875e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  36 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  3.402e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0160  50S ribosomal protein L23  32.05 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.44621e-05  decreased coverage  4.12321e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>