More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0084 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0084  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  3.54525e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0001  50S ribosomal protein L3  75.39 
 
 
191 aa  298  5e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  7.08799e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2081  50S ribosomal protein L3  75.39 
 
 
191 aa  298  5e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  4.97274e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1875  50S ribosomal protein L3  75.39 
 
 
191 aa  298  5e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.000188213  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1032  50S ribosomal protein L3  74.48 
 
 
192 aa  292  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  3.12086e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0059  50S ribosomal protein L3  73.82 
 
 
191 aa  291  5e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  6.39539e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2326  50S ribosomal protein L3  73.96 
 
 
192 aa  290  9e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  4.28305e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0034  50S ribosomal protein L3  71.88 
 
 
192 aa  285  3e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  4.82612e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1968  50S ribosomal protein L3  64.58 
 
 
192 aa  254  8e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  1.62789e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0286  50S ribosomal protein L3  59.69 
 
 
191 aa  243  8e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00181466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  39.2 
 
 
207 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  39.2 
 
 
207 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.63563e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  39.39 
 
 
216 aa  120  2e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  41.5 
 
 
214 aa  119  4e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  3.338e-09  unclonable  1.02958e-07 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  37.93 
 
 
205 aa  116  2e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  6.60439e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  36.36 
 
 
206 aa  116  2e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  4.02835e-07  hitchhiker  3.18342e-09 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  40.1 
 
 
219 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  37.13 
 
 
207 aa  114  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.58376e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  39.3 
 
 
218 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  37.81 
 
 
218 aa  114  8e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  38.31 
 
 
217 aa  114  1e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  38.31 
 
 
217 aa  114  1e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  38.31 
 
 
217 aa  114  1e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  39.8 
 
 
217 aa  114  1e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  38.61 
 
 
217 aa  113  2e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  39.09 
 
 
218 aa  113  2e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  39.79 
 
 
216 aa  113  2e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  38.81 
 
 
218 aa  113  2e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  40.59 
 
 
211 aa  112  4e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.30884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  40.51 
 
 
209 aa  111  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.45621e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  37.37 
 
 
216 aa  110  8e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  39.69 
 
 
219 aa  110  1e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  1.11519e-07  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  40.51 
 
 
209 aa  110  1e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0815  50S ribosomal protein L3  44.83 
 
 
221 aa  110  1e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000249143  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  40.43 
 
 
205 aa  109  2e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  40.43 
 
 
205 aa  110  2e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  3.6263e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  40.3 
 
 
207 aa  109  2e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  39.8 
 
 
212 aa  110  2e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.14788e-24  hitchhiker  3.84813e-05 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  40.1 
 
 
209 aa  110  2e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.9924e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  40.43 
 
 
205 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  39.2 
 
 
220 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
217 aa  108  4e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  2.76942e-07  decreased coverage  1.34206e-07 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
217 aa  108  4e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  5.38385e-07  hitchhiker  8.07722e-05 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  38.86 
 
 
214 aa  108  4e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  3.24929e-11  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  38.38 
 
 
222 aa  108  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0767  ribosomal protein L3  38.69 
 
 
236 aa  108  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.357159  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  37.5 
 
 
218 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  35.85 
 
 
211 aa  108  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  36.87 
 
 
206 aa  108  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.66904e-09  hitchhiker  5.67921e-07 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  37.5 
 
 
218 aa  108  7e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  38.73 
 
 
216 aa  107  7e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  39.9 
 
 
290 aa  107  8e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  38.83 
 
 
209 aa  107  9e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 
212 aa  107  9e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  1.67398e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  37.82 
 
 
214 aa  107  9e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  4.49005e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  40.91 
 
 
209 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  39.06 
 
 
212 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0327  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
216 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  9.00525e-05  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0348  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
217 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000116037  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  33.68 
 
 
206 aa  107  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2759  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
217 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  3.32087e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0314  50S ribosomal protein L3  39.69 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.38197e-08  hitchhiker  0.00855725 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  37.82 
 
 
217 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  1.08395e-11  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3644  50S ribosomal protein L3  39.69 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.85363e-09  hitchhiker  2.00291e-11 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0276  50S ribosomal protein L3  37.82 
 
 
216 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  7.62346e-07  normal  0.121842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0267  50S ribosomal protein L3  37.82 
 
 
217 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  4.16166e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  37.37 
 
 
216 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  1.28128e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  36.55 
 
 
219 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  38.81 
 
 
212 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.79422e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0249  50S ribosomal protein L3  37.82 
 
 
216 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.58016e-10  normal  0.145495 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  34.2 
 
 
218 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  35.42 
 
 
211 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  35.75 
 
 
217 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3019  50S ribosomal protein L3  40.84 
 
 
220 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  2.16849e-05  hitchhiker  0.0059333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  36.55 
 
 
218 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  39.2 
 
 
219 aa  104  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3068  50S ribosomal protein L3  39.18 
 
 
219 aa  104  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  7.18216e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  39.8 
 
 
205 aa  104  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  37.5 
 
 
218 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  40.11 
 
 
212 aa  104  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  39.18 
 
 
212 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  1.5584e-06  hitchhiker  7.58128e-06 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  33.81 
 
 
227 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  35.2 
 
 
213 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  37.5 
 
 
204 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1226  50S ribosomal protein L3  38 
 
 
244 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0600156  unclonable  9.85108e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  37.19 
 
 
212 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.8687e-07  unclonable  4.91767e-12 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2632  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
219 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  4.88611e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3169  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
219 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  2.63976e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  34.72 
 
 
217 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  34.52 
 
 
217 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1924  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
219 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  1.32844e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3746  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
219 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  2.1686e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3776  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
219 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  3.25408e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3478  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
219 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  8.79138e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  36.6 
 
 
245 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3804  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 
223 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000896818  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  36.6 
 
 
214 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  6.58885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  34.52 
 
 
217 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  34.38 
 
 
211 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0767  50S ribosomal protein L3  36.46 
 
 
208 aa  102  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>