More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0080 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  100 
 
 
433 aa  884  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  50.35 
 
 
426 aa  429  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  49.07 
 
 
442 aa  427  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  48.46 
 
 
441 aa  416  1e-115  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  48.45 
 
 
421 aa  412  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  2.69729e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  46.27 
 
 
421 aa  398  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  47.85 
 
 
422 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  48.1 
 
 
422 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  47.37 
 
 
422 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  44.66 
 
 
442 aa  366  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  34.1 
 
 
551 aa  239  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  32.21 
 
 
571 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  32.27 
 
 
573 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  32.27 
 
 
568 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  32.27 
 
 
570 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  32.08 
 
 
570 aa  223  5e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  31.52 
 
 
557 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  31.8 
 
 
570 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  31.71 
 
 
499 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  31.36 
 
 
495 aa  201  2e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  29.43 
 
 
499 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  30.48 
 
 
474 aa  197  2e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  31.39 
 
 
502 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  29.84 
 
 
492 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  29.89 
 
 
494 aa  185  1e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  28.63 
 
 
495 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  28.95 
 
 
491 aa  176  1e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  28.27 
 
 
473 aa  174  4e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  26.15 
 
 
501 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  28.1 
 
 
442 aa  147  4e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.84034e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.4 
 
 
404 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  28.35 
 
 
405 aa  120  4e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.99 
 
 
406 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  28.1 
 
 
405 aa  119  8e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  25.23 
 
 
470 aa  117  4e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  27.79 
 
 
406 aa  115  2e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27.79 
 
 
406 aa  115  2e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27.79 
 
 
406 aa  115  2e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  23.82 
 
 
452 aa  115  2e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  27.79 
 
 
406 aa  115  2e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.12 
 
 
413 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27.79 
 
 
406 aa  114  4e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.79 
 
 
406 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.85 
 
 
406 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  27.87 
 
 
414 aa  114  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  27.56 
 
 
406 aa  113  7e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  27.56 
 
 
406 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  27.56 
 
 
406 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  27.56 
 
 
406 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.33 
 
 
406 aa  111  2e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.86 
 
 
415 aa  112  2e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.33 
 
 
409 aa  110  4e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  27.79 
 
 
412 aa  110  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  28.34 
 
 
392 aa  110  7e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.1 
 
 
413 aa  109  9e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.29 
 
 
416 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.33 
 
 
406 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  27.6 
 
 
420 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  24.4 
 
 
896 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  25.42 
 
 
460 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  29.97 
 
 
416 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.44 
 
 
404 aa  106  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  27.42 
 
 
410 aa  106  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.37 
 
 
418 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.18 
 
 
413 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.43 
 
 
434 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.18 
 
 
413 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.2 
 
 
451 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 
408 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.75 
 
 
412 aa  104  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.89 
 
 
425 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.53 
 
 
417 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.68 
 
 
414 aa  103  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  24.46 
 
 
404 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.09 
 
 
415 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.06 
 
 
412 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.8 
 
 
434 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.39 
 
 
417 aa  102  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.93 
 
 
408 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  26.39 
 
 
428 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1458  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.94 
 
 
413 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  27.32 
 
 
425 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.5 
 
 
403 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.47 
 
 
414 aa  99.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.67 
 
 
404 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  28.16 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1412  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.9 
 
 
413 aa  99  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.82 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.68 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.15 
 
 
415 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.7 
 
 
412 aa  97.8  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  26.09 
 
 
410 aa  97.4  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  26.57 
 
 
428 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.97 
 
 
406 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  6.02764e-07 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.63 
 
 
419 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  23.43 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.97 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  26.97 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  23.76 
 
 
394 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.27 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>