More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0077 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0053  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2188  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2157  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1510  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0077  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.329264  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0456  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0384853  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1523  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1274  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0033  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2231  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0153  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0035  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1705  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0507  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0352051  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2321  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2257  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.124846  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2238  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1725  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.67576  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1712  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0518  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1464  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0461  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.689398  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0023  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0019  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0032  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0016  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  3.90105e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0065  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0054  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0016  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.67693e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0054  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.755946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0065  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  8.78402e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  98.57 
 
 
76 bp  131  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0020  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  2e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1707  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  2e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0164  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  2e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.405268  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1834  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  2e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0080  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2178  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0169  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  119  1e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0010  tRNA-Ala  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0033  tRNA-Ala  95.71 
 
 
78 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.362537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0008  tRNA-Ala  95.71 
 
 
78 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0080  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00204855  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0072  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  5.23195e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0029  tRNA-Ala  95.71 
 
 
78 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0009  tRNA-Ala  95.71 
 
 
78 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0348385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5311  tRNA-Ala  95.71 
 
 
78 bp  115  1e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124894  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0103  tRNA-Ala  95.71 
 
 
78 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00163997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5287  tRNA-Ala  95.71 
 
 
78 bp  115  1e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.231328  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5641  tRNA-Ala  95.71 
 
 
78 bp  115  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5625  tRNA-Ala  95.71 
 
 
78 bp  115  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5618  tRNA-Ala  95.71 
 
 
78 bp  115  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0704322  hitchhiker  0.00208971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000936293  normal  0.188106 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0026  tRNA-Ala  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0248198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  95.71 
 
 
79 bp  115  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  95.71 
 
 
79 bp  115  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  95.71 
 
 
79 bp  115  1e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  95.71 
 
 
79 bp  115  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  95.71 
 
 
79 bp  115  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  95.71 
 
 
79 bp  115  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  95.71 
 
 
79 bp  115  1e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla02  tRNA-Ala  95.65 
 
 
79 bp  113  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla01  tRNA-Ala  95.65 
 
 
79 bp  113  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  98.33 
 
 
76 bp  111  2e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  98.33 
 
 
76 bp  111  2e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88872e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0862  tRNA-Ala  98.33 
 
 
78 bp  111  2e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.33142e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5734  tRNA-Ala  98.33 
 
 
78 bp  111  2e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.08147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5658  tRNA-Ala  98.33 
 
 
76 bp  111  2e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  8.63381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  98.33 
 
 
76 bp  111  2e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00200718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>