84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0063 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  755  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  63.91 
 
 
360 aa  508  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  30.19 
 
 
343 aa  79.3  8e-14  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  29.56 
 
 
344 aa  79  1e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  28.57 
 
 
470 aa  75.1  2e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  31.91 
 
 
343 aa  70.1  5e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  24.18 
 
 
370 aa  69.3  9e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  29.17 
 
 
375 aa  67.4  4e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  29.08 
 
 
539 aa  66.2  8e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  26.84 
 
 
638 aa  66.2  9e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  29.37 
 
 
617 aa  66.2  9e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  24.29 
 
 
386 aa  63.5  6e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  27.22 
 
 
371 aa  62.4  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  32.35 
 
 
422 aa  62  1e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  26.43 
 
 
650 aa  61.6  2e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  25.15 
 
 
377 aa  62  2e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  25.28 
 
 
353 aa  62  2e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  23.22 
 
 
367 aa  61.2  3e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52163e-08 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  25 
 
 
375 aa  60.8  3e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  2.52439e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  25 
 
 
375 aa  60.8  3e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  7.47895e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  24.85 
 
 
349 aa  60.8  3e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  30.41 
 
 
349 aa  60.5  4e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  27.54 
 
 
377 aa  60.8  4e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  25.9 
 
 
366 aa  59.3  9e-08  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  24.31 
 
 
458 aa  58.9  1e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  27.81 
 
 
378 aa  58.9  1e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  27.67 
 
 
589 aa  56.6  6e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  24.29 
 
 
354 aa  56.6  7e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  28.95 
 
 
375 aa  56.2  8e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  26.06 
 
 
345 aa  55.8  1e-06  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  25.88 
 
 
365 aa  55.8  1e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  24.52 
 
 
353 aa  55.1  2e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  23.29 
 
 
399 aa  53.9  4e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  25.95 
 
 
368 aa  53.5  5e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  29.79 
 
 
379 aa  52.8  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  29.81 
 
 
189 aa  51.6  2e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  25.17 
 
 
320 aa  50.1  5e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  26.01 
 
 
369 aa  49.7  7e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  31.4 
 
 
186 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  23.53 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  25.97 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  23.66 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  45.65 
 
 
105 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  26.76 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  2.24938e-07 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  32.81 
 
 
560 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  35 
 
 
81 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  25.74 
 
 
321 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  29.87 
 
 
185 aa  46.2  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  27.91 
 
 
220 aa  46.2  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  24.31 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  45.65 
 
 
104 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  25.81 
 
 
218 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  32.89 
 
 
96 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  27.96 
 
 
189 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  38.24 
 
 
228 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1015  HNH endonuclease  34.78 
 
 
191 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  37.5 
 
 
81 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  41.54 
 
 
585 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  27.91 
 
 
185 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  26.21 
 
 
341 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  24.72 
 
 
189 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  25.71 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.10562e-15  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  27.91 
 
 
185 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  27.27 
 
 
178 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  30.14 
 
 
186 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  28.3 
 
 
185 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  43.48 
 
 
103 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  27.94 
 
 
185 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  29.69 
 
 
194 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  29.35 
 
 
184 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2745  HNH endonuclease  36.76 
 
 
149 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00704731  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  29.35 
 
 
184 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  32.79 
 
 
191 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  7.79297e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1061  HNH endonuclease  33.33 
 
 
118 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  35.85 
 
 
198 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  27.94 
 
 
202 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  41.82 
 
 
1187 aa  43.1  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  35.85 
 
 
198 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  27.69 
 
 
390 aa  43.1  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  43.48 
 
 
92 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  33.85 
 
 
240 aa  42.7  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.1 
 
 
596 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  35.71 
 
 
232 aa  42.7  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  3.09683e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  36.11 
 
 
230 aa  42.7  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  1.64704e-10  hitchhiker  5.78298e-10 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>