191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0056 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0056  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  100 
 
 
88 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  67.82 
 
 
328 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  59.09 
 
 
311 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  59.26 
 
 
323 aa  100  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  61.45 
 
 
417 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  57.14 
 
 
416 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  57.47 
 
 
417 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  55.17 
 
 
320 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  57.83 
 
 
487 aa  93.6  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  54.88 
 
 
419 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  56.18 
 
 
406 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  54.88 
 
 
425 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  53.49 
 
 
415 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  51.16 
 
 
327 aa  89.4  1e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  54.02 
 
 
305 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  53.49 
 
 
329 aa  88.2  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  55.17 
 
 
424 aa  87  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  57.14 
 
 
324 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  54.65 
 
 
416 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  48.86 
 
 
418 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  55.81 
 
 
417 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  53.49 
 
 
319 aa  85.1  3e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  49.41 
 
 
413 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  48.28 
 
 
338 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  45.98 
 
 
426 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  47.47 
 
 
436 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  48.51 
 
 
447 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  45.98 
 
 
727 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  45.98 
 
 
331 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  50.56 
 
 
438 aa  81.6  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  48.08 
 
 
472 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  49.44 
 
 
320 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  47.19 
 
 
428 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  49.43 
 
 
350 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  47.12 
 
 
472 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  47.12 
 
 
472 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  47.12 
 
 
472 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  47.12 
 
 
472 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  47.12 
 
 
472 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  47.12 
 
 
472 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  48.08 
 
 
491 aa  79.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  47.66 
 
 
476 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  47.66 
 
 
476 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  47.66 
 
 
476 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  48.08 
 
 
471 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  47.66 
 
 
476 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  47.66 
 
 
476 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  48.28 
 
 
350 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  45.54 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  41.67 
 
 
336 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  47.06 
 
 
313 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  53.41 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  44.44 
 
 
373 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  47.56 
 
 
313 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  42.7 
 
 
329 aa  68.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  38.95 
 
 
368 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  44.19 
 
 
389 aa  67.4  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  41.18 
 
 
334 aa  67  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  43.16 
 
 
451 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  41.86 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  41.67 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  44.83 
 
 
444 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  43.16 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  40.91 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  43.53 
 
 
423 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  41.11 
 
 
437 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  36.67 
 
 
434 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  35.56 
 
 
467 aa  63.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  43.96 
 
 
417 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  43.96 
 
 
657 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  40.45 
 
 
456 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  42.31 
 
 
310 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  40.45 
 
 
456 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  41.67 
 
 
483 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  40.45 
 
 
460 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  40.45 
 
 
460 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  42.35 
 
 
423 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 
468 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  36 
 
 
348 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  36.36 
 
 
383 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  40.7 
 
 
372 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.07 
 
 
435 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.63 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  39.51 
 
 
361 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  42.35 
 
 
328 aa  56.6  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  32.98 
 
 
345 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  36.14 
 
 
335 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  38.1 
 
 
495 aa  55.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  36.25 
 
 
399 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  38.55 
 
 
335 aa  54.3  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  37.08 
 
 
443 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  34.65 
 
 
423 aa  53.9  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  39.53 
 
 
360 aa  53.9  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  32.99 
 
 
370 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  36.67 
 
 
415 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  36.9 
 
 
392 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  40.51 
 
 
386 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
370 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  35.23 
 
 
337 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
446 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>