More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0041 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
194 aa  399  1e-110  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  73.71 
 
 
195 aa  310  8e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  77.3 
 
 
190 aa  302  2e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  76.76 
 
 
190 aa  301  4e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  69.52 
 
 
190 aa  280  1e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  68.98 
 
 
193 aa  274  7e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  68.98 
 
 
190 aa  270  7e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  68.45 
 
 
190 aa  270  9e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  67.38 
 
 
190 aa  266  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  71.18 
 
 
179 aa  264  6e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 
220 aa  239  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  61.27 
 
 
226 aa  235  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 
219 aa  235  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  58.96 
 
 
219 aa  232  2e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  59.65 
 
 
216 aa  232  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  58.43 
 
 
218 aa  232  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  58.06 
 
 
199 aa  232  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  59.88 
 
 
223 aa  229  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  55.38 
 
 
195 aa  226  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  60.89 
 
 
226 aa  224  5e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 
223 aa  224  5e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  55.32 
 
 
212 aa  224  5e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  56.28 
 
 
198 aa  224  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  6.26036e-06 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  53.68 
 
 
247 aa  222  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  56.67 
 
 
181 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  56.67 
 
 
181 aa  219  1e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 
193 aa  220  1e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  55.25 
 
 
187 aa  219  2e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 
187 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  54.75 
 
 
186 aa  218  4e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  58.47 
 
 
225 aa  218  4e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  52.08 
 
 
239 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  52.08 
 
 
239 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 
186 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
181 aa  218  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  53.68 
 
 
235 aa  217  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 
186 aa  217  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
181 aa  217  9e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 
180 aa  216  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  54.34 
 
 
202 aa  216  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  53.16 
 
 
213 aa  216  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  54.19 
 
 
186 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  55.8 
 
 
185 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 
213 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
181 aa  215  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  53.72 
 
 
216 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  57.47 
 
 
201 aa  215  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  51.67 
 
 
210 aa  214  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 
186 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 
186 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 
224 aa  214  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 
185 aa  213  1e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  53.59 
 
 
199 aa  213  2e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  54.8 
 
 
186 aa  212  2e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 
218 aa  213  2e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  51.83 
 
 
235 aa  211  4e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 
181 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 
214 aa  210  8e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  51.67 
 
 
184 aa  210  8e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 
214 aa  210  8e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 
181 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  52.57 
 
 
186 aa  209  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  52.25 
 
 
179 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 
235 aa  207  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 
181 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  53.51 
 
 
203 aa  206  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 
182 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 
184 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 
189 aa  204  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  48.95 
 
 
243 aa  201  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  51.11 
 
 
181 aa  201  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 
188 aa  200  1e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  53.97 
 
 
200 aa  200  1e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 
184 aa  200  1e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  48.59 
 
 
435 aa  197  8e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  54.44 
 
 
181 aa  196  2e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  54.44 
 
 
181 aa  196  2e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  54.44 
 
 
190 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  46.6 
 
 
209 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  47.03 
 
 
270 aa  192  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
179 aa  192  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  48.39 
 
 
206 aa  191  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
179 aa  191  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  47.09 
 
 
258 aa  190  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  46.52 
 
 
212 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  46.52 
 
 
212 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  51.67 
 
 
207 aa  189  3e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 
292 aa  189  3e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 
292 aa  189  3e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 
236 aa  189  3e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 
242 aa  189  3e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 
292 aa  189  3e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 
292 aa  189  3e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  46.6 
 
 
234 aa  189  3e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 
292 aa  189  3e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  47.64 
 
 
222 aa  188  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 
210 aa  188  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 
209 aa  187  6e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 
211 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 
211 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>