214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0033 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  100 
 
 		 306 aa  586  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  58.33 
 
 		 303 aa  348  4e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  57.33 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  54.04 
 
 		 301 aa  299  5e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  52.49 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  50 
 
 		 301 aa  285  5e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  50.84 
 
 		 302 aa  281  7.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  31.46 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  29.02 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  29.63 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  24 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  24.13 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  27.96 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.98 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  27.15 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  27.52 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  22.22 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  22.41 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  22.95 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  29.28 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.66 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.66 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  22.33 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.66 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  23.68 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  26.62 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  25.37 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  23.76 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  24.82 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.83 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.83 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  21.84 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  24.19 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  26.24 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  24.72 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  24.36 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  28.8 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  26.58 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  26.73 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  22.58 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  26.72 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  22.07 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  23.93 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.75 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  26.3 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  23.15 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  24.25 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  27.96 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  26.56 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.74 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  26.14 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  26.24 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  22.65 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.15 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  26.56 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.47 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25.56 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  25.65 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.16 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.6 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.71 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.69 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  23.67 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  24.2 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  25.87 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  28.3 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  23.1 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  24.38 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  21.99 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.73 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  26.46 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  21.95 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  21.95 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  23.58 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  22.26 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  22.4 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.25 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.26 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  22.9 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  28.44 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.91 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  22.93 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  23.18 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>