296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0023 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0023  fumarate hydratase  100 
 
 
281 aa  570  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1701  fumarate hydratase  79 
 
 
281 aa  444  1e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.451126  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1528  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  65.7 
 
 
281 aa  378  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0847181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3090  fumarate hydratase  59.86 
 
 
280 aa  323  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.69234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26960  fumarase alpha subunit  55.16 
 
 
281 aa  322  3e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2135  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  55.4 
 
 
281 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.986162  hitchhiker  0.00977913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1872  fumarate hydratase  56.27 
 
 
283 aa  318  6e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.457105  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0623  fumarate hydratase  53.74 
 
 
281 aa  316  3e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000355042  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5472  fumarate hydratase  53.96 
 
 
280 aa  312  5e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1779  fumarate hydratase  55.16 
 
 
280 aa  308  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122299  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1520  fumarate hydratase  56.58 
 
 
281 aa  308  7e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.12019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2398  fumarase alpha subunit  49.11 
 
 
280 aa  305  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.79798e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4397  fumarate hydratase  51.8 
 
 
289 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2422  fumarate hydratase  54.8 
 
 
280 aa  297  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  4.32763e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1254  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  52.16 
 
 
294 aa  297  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1954  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  52.48 
 
 
280 aa  295  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10050  fumarate hydratase  55.52 
 
 
279 aa  292  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.146733  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0007  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  55.43 
 
 
280 aa  288  5e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2748  fumarate hydratase  47.64 
 
 
280 aa  284  1e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1927  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  51.96 
 
 
280 aa  284  1e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1068  fumarate hydratase  48.75 
 
 
280 aa  281  8e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149426  normal  0.287386 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2283  fumarate hydratase  55.71 
 
 
281 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0352467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2746  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  49.11 
 
 
278 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3063  fumarate hydratase  46.26 
 
 
279 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0857  fumarate hydratase  46.93 
 
 
293 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0293622  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0301  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  56.12 
 
 
279 aa  266  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0798  fumarate hydratase  46.93 
 
 
281 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0889  fumarate hydratase  46.93 
 
 
281 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0826  fumarate hydratase  46.93 
 
 
281 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.399636  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0302  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  48.19 
 
 
282 aa  254  1e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2461  fumarate hydratase  45.91 
 
 
279 aa  253  2e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1341  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  45.91 
 
 
280 aa  253  2e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0430  fumarate hydratase  48.91 
 
 
280 aa  248  7e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1275  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  44.52 
 
 
283 aa  248  9e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1255  fumarate hydratase  41.94 
 
 
279 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3639  fumarate hydratase  42.35 
 
 
279 aa  244  2e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0297  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  48.74 
 
 
279 aa  243  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0125  fumarate hydratase  43.06 
 
 
279 aa  241  8e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.493649  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_395  tartrate/fumarate hydratase family, alpha subunit  48.4 
 
 
280 aa  235  8e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0453  fumarate hydratase  47.69 
 
 
280 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16210  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily  43.59 
 
 
292 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  1.47794e-08 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38440  fumarate hydratase, class I  42.86 
 
 
503 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2583  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha protein  43.15 
 
 
516 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3265  fumarase  42.41 
 
 
507 aa  219  4e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1000  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.72 
 
 
507 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  2.13492e-09 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4454  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.72 
 
 
507 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0897  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728674  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56300  putative fumarase  41.72 
 
 
507 aa  216  3e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2654  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  42.56 
 
 
517 aa  216  3e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0657589  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0936  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  216  3e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4902  fumarate hydratase, class I  41.38 
 
 
507 aa  215  6e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4339  fumarate hydratase, class I, putative  41.03 
 
 
507 aa  214  1e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4031  Fe-S type hydro-lyase tartrate/fumarate alpha region:Fe-S type hydro-lyase tartrate/fumarate beta region  41.03 
 
 
507 aa  213  2e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00228691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2883  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  42.81 
 
 
516 aa  214  2e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1382  fumarase  41.38 
 
 
507 aa  213  3e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4452  fumarase  40.69 
 
 
507 aa  212  4e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160872  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00655  fumarate hydratase  41.72 
 
 
505 aa  212  6e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0444664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1056  fumarase  42.96 
 
 
546 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0974  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  42.61 
 
 
519 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0854287  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2046  fumarase  42.61 
 
 
544 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.519105  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2518  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  42.21 
 
 
517 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369793  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1834  fumarase  40.83 
 
 
501 aa  208  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1955  fumarate hydratase protein  41.72 
 
 
507 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728356  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3065  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.77 
 
 
508 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1489  fumarase  40.96 
 
 
519 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0914296  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2102  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  41.72 
 
 
507 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228521  normal  0.564936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2219  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.72 
 
 
507 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00489886  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1082  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0374  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  39.16 
 
 
507 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.695152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2112  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775918  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5523  fumarase  41.38 
 
 
507 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209704  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2233  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2194  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5883  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2273  fumarase  41.72 
 
 
521 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0060992  hitchhiker  0.00178376 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1143  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  43.73 
 
 
354 aa  202  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2742  fumarase  39.79 
 
 
503 aa  201  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.993892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2334  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.69 
 
 
505 aa  201  1e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  4.49013e-05  normal  0.0431842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1778  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  40.82 
 
 
511 aa  201  1e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1941  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  201  1e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757012  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1918  fumarase  38.06 
 
 
542 aa  200  2e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2020  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  40.48 
 
 
511 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244289  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1085  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  40.48 
 
 
511 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0624  fumarate hydratase, class I  40.48 
 
 
511 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0527  fumarate hydratase, class I  40.48 
 
 
511 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1936  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  40.48 
 
 
511 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1797  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  40.48 
 
 
511 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3214  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.16 
 
 
516 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.942506  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0888  fumarase  41.96 
 
 
506 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.00222e-08  decreased coverage  1.42387e-07 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0793  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  40.48 
 
 
511 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2058  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  40.48 
 
 
511 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2035  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.91 
 
 
504 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19234  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2655  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  38.97 
 
 
505 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226929  normal  0.206098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1360  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  39.16 
 
 
522 aa  197  2e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1116  fumarase alpha subunit  41.99 
 
 
294 aa  197  2e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.395574  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0629  fumarate hydratase  43.68 
 
 
283 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3136  fumarase  40.34 
 
 
520 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119324  normal  0.0284437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1413  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  40 
 
 
507 aa  196  4e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0515679  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0188  fumarase  38.06 
 
 
507 aa  196  4e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2232  fumarase  40 
 
 
507 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>