More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0021 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0021  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  75.39 
 
 
191 aa  298  4e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00256228  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1687  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  67.02 
 
 
195 aa  270  7e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1786  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.46 
 
 
196 aa  258  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1472  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.64 
 
 
190 aa  253  1e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.606523  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0218  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.41 
 
 
188 aa  245  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.807018  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0180  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.78 
 
 
188 aa  243  1e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.24 
 
 
188 aa  242  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2163  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.97 
 
 
192 aa  215  3e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  40.53 
 
 
212 aa  150  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.8 
 
 
224 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.44 
 
 
201 aa  146  2e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.89 
 
 
213 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.22 
 
 
219 aa  143  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  8.73186e-08 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.16 
 
 
198 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.34 
 
 
218 aa  141  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.19718e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.59 
 
 
220 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.5 
 
 
220 aa  140  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
204 aa  140  1e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
220 aa  140  1e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  4.43644e-07 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.59 
 
 
220 aa  140  1e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.5 
 
 
219 aa  140  1e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
216 aa  140  1e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
220 aa  140  1e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.25 
 
 
206 aa  140  1e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
220 aa  140  1e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.16 
 
 
225 aa  140  1e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
204 aa  140  2e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.5 
 
 
219 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.59 
 
 
216 aa  139  4e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.84 
 
 
222 aa  139  4e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.31 
 
 
210 aa  138  4e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.04 
 
 
220 aa  138  5e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.16 
 
 
214 aa  138  5e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.04 
 
 
220 aa  138  5e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.97 
 
 
219 aa  138  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.44 
 
 
220 aa  138  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
220 aa  137  8e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.3 
 
 
220 aa  137  8e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.38 
 
 
217 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1649  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
197 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.33 
 
 
245 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.84 
 
 
217 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.5 
 
 
216 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.67 
 
 
224 aa  134  6e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.08 
 
 
190 aa  134  6e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.67 
 
 
204 aa  134  7e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
194 aa  134  7e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.04 
 
 
216 aa  134  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.3 
 
 
214 aa  133  1e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.5 
 
 
215 aa  132  2e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.43 
 
 
218 aa  133  2e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.82 
 
 
194 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
209 aa  132  4e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.5 
 
 
221 aa  132  4e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.81 
 
 
206 aa  132  4e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.63189e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.22 
 
 
217 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.13 
 
 
209 aa  130  8e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.89 
 
 
214 aa  130  1e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.56 
 
 
217 aa  130  1e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2113  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
249 aa  130  1e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.81 
 
 
206 aa  130  1e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1778  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.62 
 
 
192 aa  129  2e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.95 
 
 
213 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.61 
 
 
205 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3437  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
192 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.7 
 
 
223 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.7 
 
 
199 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.33 
 
 
217 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0909  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.7 
 
 
244 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1088  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.41 
 
 
187 aa  128  5e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.82 
 
 
194 aa  128  5e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.91 
 
 
206 aa  128  7e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.33 
 
 
220 aa  127  8e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.97 
 
 
222 aa  127  1e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1068  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.51 
 
 
220 aa  127  1e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09681  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.25 
 
 
218 aa  127  1e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.52 
 
 
224 aa  127  1e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5372  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.27 
 
 
192 aa  126  2e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.76 
 
 
218 aa  126  2e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2769  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.95 
 
 
227 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.28 
 
 
220 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.3 
 
 
218 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.372545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.56 
 
 
222 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0973  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.28 
 
 
220 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0969  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.28 
 
 
220 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.28 
 
 
220 aa  125  4e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.13 
 
 
225 aa  125  4e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2110  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.28 
 
 
220 aa  125  4e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.28 
 
 
220 aa  125  4e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.682807  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1031  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.28 
 
 
220 aa  125  4e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.723337  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.39 
 
 
212 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1164  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
188 aa  124  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.85336e-11 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.97 
 
 
229 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.51 
 
 
210 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.33 
 
 
212 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1275  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.98 
 
 
198 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
222 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.51 
 
 
216 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35 
 
 
222 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>