More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0018 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  100 
 
 
171 aa  341  3e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1690  peptide deformylase  67.95 
 
 
172 aa  231  5e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.736434  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  67.5 
 
 
172 aa  222  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  68.55 
 
 
174 aa  221  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  58.48 
 
 
178 aa  200  1e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2160  peptide deformylase  61.44 
 
 
171 aa  192  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  59.49 
 
 
175 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  59.49 
 
 
175 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  58.86 
 
 
175 aa  191  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1477  peptide deformylase  56.6 
 
 
173 aa  181  5e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  45.29 
 
 
178 aa  157  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  46.67 
 
 
169 aa  151  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  46.95 
 
 
178 aa  147  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  46.91 
 
 
187 aa  145  2e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  46.91 
 
 
187 aa  145  2e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  48.15 
 
 
175 aa  144  7e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  47.27 
 
 
167 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  46.63 
 
 
177 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  47.13 
 
 
173 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  45.73 
 
 
167 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  50.31 
 
 
170 aa  141  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  40.72 
 
 
169 aa  141  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  43.29 
 
 
167 aa  141  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  45.83 
 
 
175 aa  140  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  43.03 
 
 
196 aa  140  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  43.11 
 
 
171 aa  139  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  44.85 
 
 
167 aa  139  1e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  42.42 
 
 
185 aa  140  1e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  43.45 
 
 
169 aa  139  1e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  44.85 
 
 
181 aa  140  1e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  48.47 
 
 
178 aa  139  2e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  44.31 
 
 
171 aa  139  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  44.85 
 
 
167 aa  139  2e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  44.85 
 
 
167 aa  139  2e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  44.31 
 
 
172 aa  139  2e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  45.45 
 
 
167 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  45.45 
 
 
167 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  45.45 
 
 
167 aa  138  4e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  42.35 
 
 
175 aa  137  5e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  44.24 
 
 
167 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  44.24 
 
 
167 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  42.42 
 
 
185 aa  137  9e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  43.53 
 
 
170 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  41.82 
 
 
185 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  42.26 
 
 
168 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  41.04 
 
 
170 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  42.26 
 
 
168 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  43.98 
 
 
167 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  41.42 
 
 
187 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  42.26 
 
 
168 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.96537e-05 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  41.76 
 
 
171 aa  135  3e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  43.45 
 
 
170 aa  135  3e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  43.45 
 
 
170 aa  135  3e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  41.62 
 
 
170 aa  135  3e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  42.01 
 
 
168 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  42.44 
 
 
168 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  4.47721e-15 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  42.6 
 
 
175 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  43.64 
 
 
216 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  42.01 
 
 
177 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  42.94 
 
 
175 aa  134  6e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  43.03 
 
 
179 aa  134  7e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  43.86 
 
 
168 aa  134  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  43.64 
 
 
179 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  42.44 
 
 
168 aa  133  1e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  41.18 
 
 
175 aa  133  1e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  43.64 
 
 
167 aa  133  1e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  43.41 
 
 
188 aa  133  1e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.21 
 
 
185 aa  133  1e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  42.44 
 
 
168 aa  133  1e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  4.0176e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  41.07 
 
 
168 aa  133  1e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  43.64 
 
 
167 aa  133  1e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  42.68 
 
 
191 aa  132  2e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  42.69 
 
 
177 aa  132  2e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  41.18 
 
 
175 aa  132  2e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  42.44 
 
 
168 aa  132  2e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  1.33405e-06 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  43.64 
 
 
167 aa  132  2e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  43.64 
 
 
179 aa  132  2e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  43.64 
 
 
179 aa  132  2e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  42.51 
 
 
167 aa  132  2e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  42.51 
 
 
167 aa  132  2e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  41.57 
 
 
170 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  41.57 
 
 
170 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  42.01 
 
 
182 aa  132  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  41.57 
 
 
170 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  41.57 
 
 
170 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.64435e-06 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  44.51 
 
 
170 aa  131  4e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  42.6 
 
 
167 aa  131  4e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  41.92 
 
 
170 aa  131  4e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  38.46 
 
 
167 aa  131  4e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  40.7 
 
 
193 aa  131  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  44.12 
 
 
168 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  2.67775e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  41.76 
 
 
168 aa  130  7e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  45.33 
 
 
157 aa  130  8e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  42.6 
 
 
171 aa  130  1e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.12 
 
 
174 aa  130  1e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  40.59 
 
 
170 aa  129  1e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  43.2 
 
 
168 aa  129  2e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  42.01 
 
 
171 aa  129  2e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  39.88 
 
 
170 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  42.69 
 
 
168 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>