64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0015 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  100 
 
 
597 aa  1198  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.99 
 
 
590 aa  102  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  24.91 
 
 
678 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  27.07 
 
 
805 aa  87  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  27.05 
 
 
638 aa  87  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.32 
 
 
683 aa  84.7  4e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.57 
 
 
465 aa  84.3  6e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.88 
 
 
502 aa  83.2  1e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  31.94 
 
 
587 aa  82  3e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  27.21 
 
 
459 aa  82  3e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  27.21 
 
 
459 aa  82  3e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.78 
 
 
743 aa  80.5  7e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  25.36 
 
 
700 aa  80.1  1e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  31.98 
 
 
412 aa  79.3  2e-13  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.62 
 
 
732 aa  79.7  2e-13  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  27.11 
 
 
810 aa  78.6  3e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  3.28299e-05 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.93 
 
 
568 aa  76.6  1e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.25 
 
 
421 aa  75.5  2e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  25.09 
 
 
743 aa  75.1  3e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  26.82 
 
 
609 aa  74.7  5e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  26.82 
 
 
609 aa  74.7  5e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.64 
 
 
685 aa  73.6  1e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  27.32 
 
 
685 aa  73.2  1e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  22.62 
 
 
822 aa  72.4  2e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  24.45 
 
 
853 aa  71.2  5e-11  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  26.83 
 
 
691 aa  70.9  7e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  26.75 
 
 
653 aa  69.3  2e-10  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38897e-05 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.32 
 
 
729 aa  66.6  1e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  27.05 
 
 
705 aa  66.2  2e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  21.65 
 
 
498 aa  64.7  5e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  27 
 
 
539 aa  64.3  6e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  29.67 
 
 
655 aa  64.3  6e-09  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  22.55 
 
 
741 aa  63.9  8e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  23.99 
 
 
781 aa  63.9  8e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  23.58 
 
 
498 aa  63.5  1e-08  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.14 
 
 
626 aa  62.4  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.12 
 
 
754 aa  62.4  2e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.01 
 
 
698 aa  62.8  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.11 
 
 
530 aa  62.8  2e-08  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  23.68 
 
 
899 aa  62  3e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  21.92 
 
 
352 aa  60.5  8e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  2.13908e-07 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  23.68 
 
 
734 aa  60.1  1e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  32.89 
 
 
481 aa  59.3  2e-07  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  22.64 
 
 
999 aa  58.5  3e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.33 
 
 
585 aa  57  1e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  9.45382e-05 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  23.16 
 
 
687 aa  53.9  8e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  25.57 
 
 
845 aa  52.8  2e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  3.10884e-08 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  23.5 
 
 
629 aa  52  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  26.57 
 
 
603 aa  51.6  4e-05  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  26.18 
 
 
513 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  20.36 
 
 
765 aa  49.7  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.91313e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  22.92 
 
 
696 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  22.63 
 
 
513 aa  47.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.68 
 
 
449 aa  47  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  26.11 
 
 
714 aa  47  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  26.11 
 
 
714 aa  47  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 
398 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  24.38 
 
 
662 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  22.5 
 
 
862 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  1.42009e-08 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.57 
 
 
559 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  27.1 
 
 
583 aa  45.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  27.61 
 
 
900 aa  44.3  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  21.82 
 
 
303 aa  44.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.21 
 
 
559 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>