More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0012 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  55.07 
 
 
210 aa  249  3e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  56.52 
 
 
222 aa  248  6e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  54.41 
 
 
214 aa  244  8e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  54.15 
 
 
213 aa  241  4e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  51.94 
 
 
211 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  51.94 
 
 
211 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  51.94 
 
 
211 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  48.06 
 
 
207 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  45.1 
 
 
213 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.76342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  48.22 
 
 
200 aa  196  2e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  38.73 
 
 
219 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  38.73 
 
 
219 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  38.73 
 
 
219 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  38.73 
 
 
219 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  38.73 
 
 
219 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  38.73 
 
 
219 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  38.73 
 
 
219 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  38.24 
 
 
219 aa  164  1e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  38.73 
 
 
219 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  39.11 
 
 
237 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  38.68 
 
 
216 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  38.12 
 
 
218 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  38.86 
 
 
225 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  38.24 
 
 
219 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  38.24 
 
 
219 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  38.24 
 
 
219 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  36.06 
 
 
227 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  42.03 
 
 
225 aa  157  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  35.58 
 
 
224 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  39.69 
 
 
219 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  39.71 
 
 
219 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  37.75 
 
 
219 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  37.75 
 
 
223 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  36.02 
 
 
217 aa  152  3e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  36.76 
 
 
217 aa  151  6e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  33.5 
 
 
210 aa  151  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.38152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  38.03 
 
 
233 aa  151  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  39.58 
 
 
211 aa  150  9e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  36.95 
 
 
230 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  38.12 
 
 
211 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  38.66 
 
 
219 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  38.66 
 
 
219 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  37.93 
 
 
356 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  38.42 
 
 
243 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  37.56 
 
 
239 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  37.56 
 
 
239 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  36.45 
 
 
220 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  37.56 
 
 
239 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  37.62 
 
 
228 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  37.75 
 
 
242 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  38.66 
 
 
219 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  36.27 
 
 
220 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.11609e-05  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  38.66 
 
 
219 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  38.66 
 
 
219 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  39.51 
 
 
211 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  38.66 
 
 
219 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  37.56 
 
 
239 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  37.75 
 
 
219 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  39.18 
 
 
219 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  38.39 
 
 
216 aa  148  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  38.05 
 
 
230 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  35.78 
 
 
221 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  37.25 
 
 
242 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  36.79 
 
 
248 aa  147  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  37.75 
 
 
242 aa  147  1e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  35.12 
 
 
246 aa  147  1e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  35.35 
 
 
230 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  38.54 
 
 
211 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  35.24 
 
 
211 aa  145  4e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  36.6 
 
 
234 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  36.27 
 
 
211 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  36.68 
 
 
267 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  34.85 
 
 
214 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  36.68 
 
 
267 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  35.64 
 
 
225 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  35.64 
 
 
225 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  36.55 
 
 
278 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  34.12 
 
 
225 aa  141  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  34.63 
 
 
234 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  37.75 
 
 
236 aa  141  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  35.38 
 
 
218 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  36.82 
 
 
239 aa  140  1e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  34.58 
 
 
235 aa  140  1e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  36.36 
 
 
221 aa  140  2e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  34.52 
 
 
284 aa  139  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  36.45 
 
 
219 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  38.34 
 
 
228 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  34.63 
 
 
251 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  33.01 
 
 
210 aa  139  4e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  35.12 
 
 
211 aa  138  5e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  33.17 
 
 
272 aa  138  5e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  38.02 
 
 
231 aa  138  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  36.41 
 
 
213 aa  137  8e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  35.94 
 
 
202 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  33.01 
 
 
225 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  36.27 
 
 
213 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  34.15 
 
 
258 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  34.15 
 
 
214 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 
207 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>