38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0007 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  100 
 
 
405 aa  818  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  65.6 
 
 
412 aa  558  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  66.75 
 
 
411 aa  558  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  66.17 
 
 
406 aa  558  1e-158  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  66.67 
 
 
408 aa  547  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0042  hypothetical protein  65.69 
 
 
408 aa  540  1e-152  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.233125  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  65.93 
 
 
408 aa  541  1e-152  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0015  hypothetical protein  65.69 
 
 
408 aa  538  1e-152  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.2869  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  54.17 
 
 
403 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  45.41 
 
 
396 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  45.93 
 
 
396 aa  328  9e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0050  hypothetical protein  37.14 
 
 
416 aa  275  8e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0968  hypothetical protein  34.91 
 
 
423 aa  252  8e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2605  hypothetical protein  36.52 
 
 
412 aa  249  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000329131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0727  hypothetical protein  36.48 
 
 
413 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190594  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0736  hypothetical protein  35.18 
 
 
413 aa  240  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000863321  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1061  hypothetical protein  37.89 
 
 
413 aa  236  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  2.3277e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1594  hydrolase (HAD superfamily)  32.3 
 
 
396 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  33.96 
 
 
398 aa  200  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  24.16 
 
 
360 aa  72  2e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  22.1 
 
 
349 aa  71.2  3e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  29.03 
 
 
195 aa  54.7  3e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  32.94 
 
 
359 aa  54.7  3e-06  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 
205 aa  50.8  4e-05  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  28.69 
 
 
201 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 
199 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  29.17 
 
 
195 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  32.2 
 
 
215 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  29.06 
 
 
199 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  28.07 
 
 
195 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
199 aa  43.1  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  31.36 
 
 
206 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  29.06 
 
 
199 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  29.06 
 
 
199 aa  43.1  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  29.06 
 
 
199 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  29.06 
 
 
199 aa  43.1  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  29.06 
 
 
199 aa  43.1  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  29.06 
 
 
199 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>