More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0004 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  46.88 
 
 		 804 aa  707    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  46.88 
 
 		 804 aa  707    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  45.42 
 
 		 804 aa  668    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  47.14 
 
 		 807 aa  722    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  51.12 
 
 		 795 aa  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  48.69 
 
 		 806 aa  710    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  47.33 
 
 		 804 aa  703    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1346  DNA gyrase subunit B  48.01 
 
 		 809 aa  687    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0003  DNA gyrase subunit B  45.03 
 
 		 851 aa  657    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  47.01 
 
 		 804 aa  695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0112  DNA gyrase, B subunit  44.47 
 
 		 795 aa  654    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.153062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3440  DNA gyrase subunit B  42.93 
 
 		 842 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.683175  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0101  DNA gyrase subunit B  45.22 
 
 		 822 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0004  DNA gyrase, B subunit  45.95 
 
 		 814 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  73.37 
 
 		 769 aa  1180    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  47.98 
 
 		 798 aa  696    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0125  DNA gyrase subunit B  45.32 
 
 		 810 aa  670    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0011  DNA gyrase, B subunit  49.56 
 
 		 805 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  48.7 
 
 		 805 aa  706    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0015  DNA gyrase subunit B  45.19 
 
 		 811 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0087  DNA gyrase subunit B  45.22 
 
 		 822 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0003  DNA gyrase, B subunit  43.98 
 
 		 832 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0003  DNA gyrase subunit B  45.22 
 
 		 822 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0925325  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  47.9 
 
 		 805 aa  713    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  47.65 
 
 		 805 aa  713    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  48.63 
 
 		 805 aa  707    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  48.82 
 
 		 805 aa  719    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  47.39 
 
 		 811 aa  692    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0417  DNA gyrase subunit B  44.1 
 
 		 798 aa  669    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  57.75 
 
 		 633 aa  645    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  48.51 
 
 		 806 aa  699    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0004  DNA gyrase subunit B  45.83 
 
 		 813 aa  661    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0791906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0299  DNA gyrase subunit B  45.22 
 
 		 822 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  46.96 
 
 		 807 aa  699    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  48.56 
 
 		 805 aa  711    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1346  DNA gyrase subunit B  45.19 
 
 		 811 aa  649    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  50.38 
 
 		 795 aa  740    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3184  DNA gyrase subunit B  46.14 
 
 		 824 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  47.89 
 
 		 804 aa  718    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  50.25 
 
 		 795 aa  733    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  49.56 
 
 		 797 aa  714    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  46.45 
 
 		 813 aa  688    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  48.88 
 
 		 805 aa  706    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0003  DNA gyrase subunit B  66.75 
 
 		 769 aa  1045    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0003  DNA gyrase subunit B  44.93 
 
 		 810 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.835475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0004  DNA gyrase subunit B  45 
 
 		 802 aa  635    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  50.19 
 
 		 794 aa  725    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3241  DNA gyrase subunit B  45.47 
 
 		 822 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  46.74 
 
 		 795 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0005  DNA gyrase subunit B  46.97 
 
 		 813 aa  669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  49.07 
 
 		 805 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0721  DNA gyrase, B subunit  45.57 
 
 		 783 aa  657    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0620  DNA gyrase, B subunit  43.48 
 
 		 798 aa  658    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0004  DNA gyrase subunit B  45.76 
 
 		 805 aa  643    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0003  DNA gyrase, B subunit  44.65 
 
 		 870 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  48.88 
 
 		 808 aa  719    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0005  DNA gyrase subunit B  46.03 
 
 		 813 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0003  DNA gyrase subunit B  46.82 
 
 		 798 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0221229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  48.69 
 
 		 806 aa  710    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4460  DNA gyrase subunit B  45.71 
 
 		 823 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318757  normal  0.407237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  49.38 
 
 		 805 aa  724    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0121  DNA gyrase subunit B  45.44 
 
 		 810 aa  672    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.853058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0004  DNA gyrase subunit B  46.59 
 
 		 813 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  48.47 
 
 		 805 aa  723    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0004  DNA gyrase subunit B  46.04 
 
 		 813 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0771659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0006  DNA gyrase subunit B  45.43 
 
 		 811 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2886  DNA gyrase, B subunit  46.03 
 
 		 812 aa  676    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0131  DNA gyrase, B subunit  45.45 
 
 		 802 aa  667    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.155863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  46.21 
 
 		 805 aa  706    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0007  DNA gyrase subunit B  44.91 
 
 		 805 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.197226  normal  0.376081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3717  DNA gyrase, B subunit  47.28 
 
 		 809 aa  695    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2555  DNA gyrase subunit B  46.39 
 
 		 824 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0003  DNA gyrase subunit B  44.17 
 
 		 877 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2235  DNA gyrase subunit B  45.22 
 
 		 822 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  47.9 
 
 		 806 aa  712    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3603  DNA gyrase subunit B  46.72 
 
 		 815 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0003  DNA gyrase subunit B  45.22 
 
 		 822 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4146  DNA gyrase subunit B  43.85 
 
 		 868 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.66151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  47.07 
 
 		 807 aa  709    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  47.55 
 
 		 807 aa  703    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0004  DNA gyrase subunit B  49.56 
 
 		 805 aa  712    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.850847  unclonable  0.0000000000498396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0004  DNA gyrase subunit B  49.69 
 
 		 805 aa  712    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666874  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  47.51 
 
 		 805 aa  725    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0004  DNA gyrase, B subunit  49.88 
 
 		 805 aa  720    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.12 
 
 		 633 aa  648    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0014  DNA gyrase subunit B  46.15 
 
 		 800 aa  669    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0003  DNA gyrase subunit B  45.78 
 
 		 824 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  48.64 
 
 		 806 aa  703    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0008  DNA gyrase subunit B  46.21 
 
 		 812 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2850  DNA gyrase subunit B  45.22 
 
 		 822 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60732  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0003  DNA gyrase subunit B  46.39 
 
 		 824 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.43 
 
 		 628 aa  657    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  47.49 
 
 		 808 aa  704    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  46.38 
 
 		 812 aa  692    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0012  DNA gyrase subunit B  49.81 
 
 		 805 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000257607 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0003  DNA gyrase subunit B  79.53 
 
 		 773 aa  1239    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.380476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  48.99 
 
 		 802 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  73.5 
 
 		 769 aa  1181    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0416  DNA gyrase subunit B  44.98 
 
 		 812 aa  653    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.38 
 
 		 805 aa  718    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>