More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0001 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
437 aa  885  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.11482  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  50.46 
 
 
436 aa  467  1e-130  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1853  chromosomal replication initiation protein  52.18 
 
 
436 aa  463  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  51.26 
 
 
436 aa  459  1e-128  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.95 
 
 
441 aa  436  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  46.87 
 
 
440 aa  418  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  46.54 
 
 
440 aa  416  1e-115  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  46.77 
 
 
440 aa  418  1e-115  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0001  chromosomal replication initiation protein  46.7 
 
 
442 aa  411  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0001  chromosomal replication initiation protein  46.08 
 
 
435 aa  402  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  38.06 
 
 
450 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  37.89 
 
 
450 aa  316  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  37.9 
 
 
446 aa  305  1e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.15 
 
 
458 aa  302  8e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.3 
 
 
446 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  37.3 
 
 
446 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  36.36 
 
 
446 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  36.36 
 
 
446 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  36.36 
 
 
446 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  36.36 
 
 
446 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  36.36 
 
 
446 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  36.38 
 
 
446 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  36.59 
 
 
446 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.59 
 
 
446 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.93 
 
 
454 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.96 
 
 
587 aa  293  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  40.47 
 
 
457 aa  293  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  40.47 
 
 
457 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.67 
 
 
591 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  37 
 
 
451 aa  288  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.89 
 
 
446 aa  286  6e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  36.83 
 
 
443 aa  285  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.89 
 
 
566 aa  285  1e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  1.50843e-05  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.16 
 
 
444 aa  285  2e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.89 
 
 
463 aa  283  3e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  36.71 
 
 
449 aa  283  4e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.73 
 
 
515 aa  282  7e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  41.19 
 
 
460 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.75 
 
 
453 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  34.1 
 
 
442 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  43.41 
 
 
450 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.36 
 
 
473 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.84064e-14 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  40.9 
 
 
458 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  35.84 
 
 
459 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.42 
 
 
528 aa  279  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.63 
 
 
474 aa  279  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  3.98294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.07 
 
 
443 aa  278  9e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  41.47 
 
 
443 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  37.19 
 
 
500 aa  276  6e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  38.59 
 
 
440 aa  275  1e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  35.09 
 
 
441 aa  275  1e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.39 
 
 
721 aa  275  1e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.23182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  32.97 
 
 
482 aa  275  2e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.12 
 
 
456 aa  275  2e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.83 
 
 
454 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.18 
 
 
503 aa  273  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 
615 aa  273  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  4.79277e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.47 
 
 
506 aa  273  4e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  39.41 
 
 
582 aa  273  4e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  5.23076e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  34.52 
 
 
453 aa  273  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  34.52 
 
 
453 aa  273  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.76 
 
 
509 aa  272  8e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.96 
 
 
489 aa  272  9e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.42 
 
 
527 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.29 
 
 
449 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.12 
 
 
480 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  35.97 
 
 
478 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  37.71 
 
 
492 aa  270  3e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  32.89 
 
 
453 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  40 
 
 
436 aa  269  7e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  38.46 
 
 
494 aa  269  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  36.15 
 
 
495 aa  269  9e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  36.15 
 
 
495 aa  269  9e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  36.15 
 
 
495 aa  269  9e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.62 
 
 
453 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  41.02 
 
 
445 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.48 
 
 
652 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  5.05913e-06  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.06 
 
 
539 aa  266  4e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.23 
 
 
490 aa  266  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.79 
 
 
447 aa  266  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.12 
 
 
534 aa  266  6e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.87 
 
 
450 aa  265  8e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.57 
 
 
518 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  39.19 
 
 
490 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  41.32 
 
 
557 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  32.52 
 
 
456 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.43 
 
 
461 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  32.52 
 
 
460 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  37.4 
 
 
491 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  38.64 
 
 
597 aa  262  7e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  2.78732e-07  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  32.68 
 
 
460 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.72 
 
 
476 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  2.40109e-09  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0001  chromosomal replication initiation protein  40.52 
 
 
453 aa  261  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.817172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  36.58 
 
 
472 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.56 
 
 
562 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  6.90317e-08  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  33.26 
 
 
452 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  37.29 
 
 
491 aa  260  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  33.26 
 
 
452 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.36 
 
 
570 aa  259  5e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0001  chromosomal replication initiation protein  39.94 
 
 
454 aa  259  5e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>