More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1771 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 247 aa  511  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  61.94 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  60.48 
 
 		 249 aa  294  7e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  56.15 
 
 		 247 aa  284  7e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  54.89 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  52.24 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  51.84 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  53.69 
 
 		 249 aa  252  3e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  50.61 
 
 		 249 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  51.76 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0492  diaminopimelate epimerase  54.17 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  38.29 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  32.96 
 
 		 272 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  32.22 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  35.47 
 
 		 259 aa  121  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  34.16 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  32.69 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  36.06 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  33.99 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  33.2 
 
 		 275 aa  118  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0071  diaminopimelate epimerase  32.28 
 
 		 245 aa  119  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  32.58 
 
 		 264 aa  118  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  34.38 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  35.5 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  32.17 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  34.21 
 
 		 282 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 232 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  30.69 
 
 		 279 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  30.6 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  36.09 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  33.82 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  33.05 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  33.05 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  33.05 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  34.11 
 
 		 283 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  31.5 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  31.96 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  34.76 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  37.32 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  31.49 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  33.97 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  31.13 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  33.92 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  31.65 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  32.31 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  31.78 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  33.04 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  31.06 
 
 		 282 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  32.31 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  31.62 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  29.54 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  32.2 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  32.76 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  29.79 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  29.36 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  31.12 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  30.04 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0714  diaminopimelate epimerase  33.18 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  26.94 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1416  diaminopimelate epimerase  33.47 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1270  diaminopimelate epimerase  33.47 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000437124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  28.36 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  26.74 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  33.47 
 
 		 283 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  29.2 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  27.84 
 
 		 274 aa  99  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  28.36 
 
 		 281 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  27.74 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  28 
 
 		 279 aa  98.6  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  27.47 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  27.47 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  27.47 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  28.21 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  27.47 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  28.21 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  27.47 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  27.47 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  27.47 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  28.21 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  28.21 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  26.57 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  27.47 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  28.21 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  30.47 
 
 		 288 aa  96.3  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  27.47 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0671  diaminopimelate epimerase  30.4 
 
 		 309 aa  95.9  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00498295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>