78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1770 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1770  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  100 
 
 
223 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1517  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  45.5 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1703  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  45.5 
 
 
243 aa  199  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00443549  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1885  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  45.41 
 
 
244 aa  197  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0073  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  44.95 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0055  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain protein  43.44 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359095  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1179  hypothetical protein  32.13 
 
 
330 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1041  putative bax protein  35 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1947  bax protein, putative  37.78 
 
 
270 aa  118  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  33.64 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1803  bax protein, putative  30.95 
 
 
290 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03942  uncharacterized FlgJ-related protein  44.36 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2128  hypothetical protein  41.04 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419683  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2213  bax protein, putative  34.76 
 
 
270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4499  hypothetical protein  34.76 
 
 
270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2158  bax protein, putative  34.76 
 
 
270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0789235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  43.61 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2208  bax protein, putative  34.76 
 
 
270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000122169  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2226  bax protein, putative  34.76 
 
 
270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  normal  0.0812518 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1338  hypothetical protein  46.27 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1957  bax protein, putative  35.43 
 
 
270 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2119  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.43 
 
 
270 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0221355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2018  bax protein, putative  35.43 
 
 
270 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0400  bax protein, putative  32.73 
 
 
259 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.342974  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4482  Bax domain-containing protein  38.04 
 
 
297 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2352  bax protein, putative  33.16 
 
 
255 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3701  bax protein, putative  32.85 
 
 
301 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  29.65 
 
 
304 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2022  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  39.2 
 
 
272 aa  101  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2061  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.66 
 
 
286 aa  101  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1997  bax protein, putative  37.23 
 
 
290 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0978  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  31.34 
 
 
354 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00771467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003479  putative Bax protein  38.06 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0684  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  41.35 
 
 
320 aa  99.8  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0161528  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2226  Bax protein, putative  30.05 
 
 
275 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2111  transcriptional regulator, Fis family protein  39.1 
 
 
309 aa  99.8  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  normal  0.43033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1578  putative lipoprotein  30.81 
 
 
245 aa  96.7  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.690527  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3159  uncharacterized FlgJ-related protein-like  30.88 
 
 
353 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2223  Bax protein, putative  33.54 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2413  Bax protein, putative  37.21 
 
 
275 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02291  hypothetical protein  38.76 
 
 
278 aa  94.7  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0872  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  36.84 
 
 
342 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2975  putative bax protein  36.62 
 
 
293 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0151  hypothetical protein  38.26 
 
 
278 aa  81.6  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2496  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.24 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3893  hypothetical protein  34.01 
 
 
274 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0140  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.33 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0144  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3952  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03373  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4946  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.481244  normal  0.092226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4066  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03422  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3773  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3877  hypothetical protein  32.39 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4046  hypothetical protein  32.39 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3860  hypothetical protein  32.39 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3986  hypothetical protein  32.39 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3941  hypothetical protein  32.39 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4894  hypothetical protein  32.59 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1243  putative exported amidase  34.78 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0417  BAX protein  28.5 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0422  BAX protein  33.08 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3268  BAX protein  35.25 
 
 
307 aa  62.4  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2235  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.02 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1812  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.94 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0555239  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02068  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.82 
 
 
74 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0379414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2771  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  50 
 
 
307 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.133297  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1782  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  24.02 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3400  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.43 
 
 
157 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.86 
 
 
568 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  31.78 
 
 
390 aa  45.1  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2956  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.11 
 
 
310 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1970  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  26.67 
 
 
370 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1289  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.01 
 
 
348 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0429221  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0148  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.67 
 
 
332 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30 
 
 
332 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24080  flagellar rod assembly protein/muramidase  24.76 
 
 
325 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>