More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1760 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  100 
 
 
664 aa  1350    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  47.9 
 
 
656 aa  609  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  40.37 
 
 
690 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  39.43 
 
 
664 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  39.97 
 
 
702 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  39.57 
 
 
718 aa  452  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  25.87 
 
 
680 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  24.82 
 
 
713 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  22.76 
 
 
710 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  23.52 
 
 
711 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
688 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
656 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  23.23 
 
 
703 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 
728 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 
638 aa  107  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  23.82 
 
 
666 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 
730 aa  100  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  22.05 
 
 
693 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  22.45 
 
 
690 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 
653 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.14 
 
 
784 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 
653 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.04 
 
 
721 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 
653 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.4 
 
 
712 aa  94.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 
708 aa  93.2  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 
721 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 
652 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  23.49 
 
 
721 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  22.9 
 
 
706 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  22.9 
 
 
706 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.9 
 
 
706 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  22.9 
 
 
706 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  22.61 
 
 
809 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  29.82 
 
 
706 aa  91.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  22.9 
 
 
809 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  21.71 
 
 
784 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  21.57 
 
 
784 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 
653 aa  91.3  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.88 
 
 
653 aa  90.9  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 
653 aa  90.9  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 
731 aa  90.1  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  22.51 
 
 
653 aa  90.1  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  21.43 
 
 
653 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  23.09 
 
 
809 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.35 
 
 
666 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  23.21 
 
 
665 aa  88.2  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.67 
 
 
666 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  33.33 
 
 
618 aa  88.2  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 
657 aa  88.2  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.53 
 
 
666 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  30.33 
 
 
659 aa  88.2  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  22.7 
 
 
809 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  22.67 
 
 
666 aa  87.4  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
644 aa  87.4  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 
731 aa  87  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.67 
 
 
774 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  22.74 
 
 
782 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.8 
 
 
659 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  28.36 
 
 
646 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  22.76 
 
 
774 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 
715 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  22.7 
 
 
774 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.09 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 
732 aa  85.1  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 
777 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.68 
 
 
663 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  22.9 
 
 
774 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.26 
 
 
666 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.68 
 
 
663 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  22.9 
 
 
774 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  22.9 
 
 
774 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.08 
 
 
663 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  22.68 
 
 
663 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  22.68 
 
 
663 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 
700 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  22.54 
 
 
663 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  22.68 
 
 
663 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  22.9 
 
 
774 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  21.83 
 
 
739 aa  84  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  27.27 
 
 
656 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  21.38 
 
 
635 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 
700 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 
700 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 
700 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  22.1 
 
 
717 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  21.29 
 
 
675 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  22.16 
 
 
782 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  20.15 
 
 
687 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 
624 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 
700 aa  81.6  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.27 
 
 
650 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 
597 aa  80.5  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.13 
 
 
650 aa  80.5  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 
700 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  34.46 
 
 
650 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  34.46 
 
 
650 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 
700 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  34.46 
 
 
650 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  21.75 
 
 
675 aa  79.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>