More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1719 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1719  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 355 aa  715    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  79.72 
 
 		 355 aa  596  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  80 
 
 		 355 aa  594  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  78.86 
 
 		 355 aa  579  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  78.03 
 
 		 355 aa  555  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  77.18 
 
 		 355 aa  553  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  77.18 
 
 		 355 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  77.18 
 
 		 355 aa  553  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  72.96 
 
 		 355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  68.45 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  60.3 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  54.02 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  54.34 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  57.31 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  55.75 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  52.57 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  54.25 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  55.17 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  52.01 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  51.72 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  54.68 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  53.43 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  53.43 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 355 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  51.29 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  51.97 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 		 361 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  53.16 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  55.75 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  52.57 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 363 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>