280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1716 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1716  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
147 aa  289  7e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.463602  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0743  lipoprotein signal peptidase  62.59 
 
 
148 aa  186  7e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1566  lipoprotein signal peptidase  63.12 
 
 
155 aa  179  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1790  lipoprotein signal peptidase  61.94 
 
 
160 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434015  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0410  lipoprotein signal peptidase  56.55 
 
 
156 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0384  lipoprotein signal peptidase  56.55 
 
 
156 aa  168  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1808  lipoprotein signal peptidase  60.54 
 
 
150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.154233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1596  lipoprotein signal peptidase  55.17 
 
 
156 aa  164  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0079  lipoprotein signal peptidase  54.23 
 
 
150 aa  145  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2038  lipoprotein signal peptidase  54.89 
 
 
153 aa  140  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  32.14 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  30.56 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  33.96 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 
164 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 
178 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  31.93 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  31.08 
 
 
165 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 
173 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  29.03 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  33.09 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 
358 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 
178 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 
166 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 
166 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 
166 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  30.14 
 
 
172 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  29.55 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  30.71 
 
 
160 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  28.95 
 
 
173 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  33.91 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  27.1 
 
 
160 aa  57  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  27.74 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  34.85 
 
 
166 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  30.87 
 
 
169 aa  57  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  27.74 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  33.03 
 
 
172 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  33.03 
 
 
172 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  29.87 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  29.91 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  33.8 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  30.99 
 
 
182 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  33.33 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  31.2 
 
 
170 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  28.42 
 
 
199 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  28.21 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 
173 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  32.37 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  28.28 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1207  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 
170 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31544  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 
166 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  31.03 
 
 
171 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 
174 aa  53.9  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1135  lipoprotein signal peptidase  34.88 
 
 
166 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 
170 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
168 aa  53.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  29.45 
 
 
170 aa  53.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 
170 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  32.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  32.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  28.85 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  28.67 
 
 
157 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  32.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  32.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 
204 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  32.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  32.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  28.19 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 
207 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>