More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1687 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1687  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
195 aa  387  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1786  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  70.26 
 
 
196 aa  273  8e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0021  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  67.02 
 
 
192 aa  270  7e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  66.32 
 
 
191 aa  262  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00256228  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1472  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.16 
 
 
190 aa  248  6e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.606523  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0180  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.43 
 
 
188 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0218  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.43 
 
 
188 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.807018  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.38 
 
 
188 aa  236  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2163  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.38 
 
 
192 aa  230  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.44 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.89 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.34 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.34 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.37 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
212 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.04 
 
 
225 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.89 
 
 
222 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.53 
 
 
220 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2113  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.91 
 
 
249 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03201  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.98 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.33 
 
 
222 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.8 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.61 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.22 
 
 
220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.31 
 
 
217 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.78 
 
 
219 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
204 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.31 
 
 
212 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.38 
 
 
194 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.76 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1068  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.27 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.34 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.92 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.7 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.46 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.49 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3437  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.54 
 
 
192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.7 
 
 
220 aa  128  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.51 
 
 
219 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.38 
 
 
220 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.38 
 
 
220 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.61 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.38 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.94 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.38 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.23 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1778  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.06 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.91 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.86 
 
 
219 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.11 
 
 
194 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
210 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.17 
 
 
220 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.61 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.67 
 
 
212 aa  124  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1649  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.97 
 
 
197 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318783  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.25 
 
 
212 aa  124  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.3 
 
 
220 aa  124  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0999  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.28 
 
 
194 aa  124  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.797413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.51 
 
 
219 aa  124  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.3 
 
 
217 aa  124  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
212 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  39.13 
 
 
212 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.22 
 
 
212 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.22 
 
 
212 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
212 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
212 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.76 
 
 
209 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.22 
 
 
212 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.61 
 
 
206 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
212 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.22 
 
 
212 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.22 
 
 
212 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
212 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
212 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.8 
 
 
222 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.62 
 
 
206 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.6 
 
 
194 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
212 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.66 
 
 
206 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.84 
 
 
216 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.61 
 
 
204 aa  122  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
210 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.43 
 
 
224 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
213 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.25 
 
 
215 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.31 
 
 
210 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.84 
 
 
216 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.3 
 
 
212 aa  121  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.84 
 
 
221 aa  121  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.3 
 
 
212 aa  121  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.3 
 
 
212 aa  121  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.87 
 
 
218 aa  120  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.75 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.9 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.61 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.22 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.55 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>