103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1683 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1683  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.792102  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1761  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2040  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000158642  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1468  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 74 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1416  tRNA-Arg  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000281617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000388984  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000884624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0037  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0771  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000219464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0019  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0019  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230793  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0053  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0223382  normal  0.521756 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0036  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.269516  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0012  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.682919  normal  0.0699826 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0099  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_R0070  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0004  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0033  tRNA-Arg  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.49867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0033  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0001  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0043  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0037  tRNA-Arg  83.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678102  normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0045  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0007  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0847038  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0018  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000528633  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0011  tRNA-Arg  83.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.223913  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0063  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257054  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0003  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0048  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0624  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00406719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>