82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1665 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1665  disulfide isomerase  100 
 
 
223 aa  453  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0951  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.19 
 
 
220 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.74 
 
 
220 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325546  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1013  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.74 
 
 
220 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000248495  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0559  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  31.46 
 
 
216 aa  123  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0883  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  28.7 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1021  putative thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.25 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00252175  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0954  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  27.35 
 
 
223 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  31.19 
 
 
223 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  31.19 
 
 
223 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  32.02 
 
 
221 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  31.19 
 
 
223 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  31.19 
 
 
223 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  30.59 
 
 
223 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  31.65 
 
 
222 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 
220 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  29.26 
 
 
218 aa  100  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.88 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2110  hypothetical protein  30.23 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3871  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.86 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4023  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0433  disulfide isomerase  30.18 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.529354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0856  disulfide isomerase  27.15 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.68 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  28.57 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  23.7 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  22.96 
 
 
212 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.76 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  21.54 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  23.56 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  23.58 
 
 
216 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.48 
 
 
202 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  23.44 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  23.96 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  23.5 
 
 
200 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  23.5 
 
 
214 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  23.44 
 
 
202 aa  48.5  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  23.38 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  23.38 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  23.21 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  23.38 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  23.38 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  24.46 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  23.74 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  23.89 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  23.74 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  22.77 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  21.76 
 
 
251 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  22.6 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  21.76 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  21.9 
 
 
185 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.72 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  21.24 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  20.37 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  20.83 
 
 
205 aa  45.1  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  23.44 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  23.15 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.02 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  21.63 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  22.69 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  24.35 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  22.55 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  23.11 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09722  DSBA oxidoreductase  23.93 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.412545  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  21.92 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  22.62 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  20.74 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  25.41 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  23.04 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  21.15 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  21.15 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  23.7 
 
 
212 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  23.23 
 
 
203 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  24 
 
 
218 aa  42  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3999  putative disulfide isomerase  26.39 
 
 
200 aa  42  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.136528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  20.74 
 
 
217 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>