More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1652 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  100 
 
 		 511 aa  1036    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  54.49 
 
 		 511 aa  579  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.32 
 
 		 511 aa  571  1e-161  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  52.64 
 
 		 511 aa  560  1e-158  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  53.74 
 
 		 511 aa  557  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  54.03 
 
 		 510 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.45 
 
 		 509 aa  273  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 		 526 aa  269  8e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 538 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  31.64 
 
 		 546 aa  256  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.63 
 
 		 538 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  30.69 
 
 		 518 aa  250  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  28.27 
 
 		 518 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 		 576 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 539 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.56 
 
 		 540 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 		 534 aa  224  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 		 555 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 		 563 aa  217  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.45 
 
 		 534 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.28 
 
 		 502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.52 
 
 		 534 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 532 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 532 aa  196  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  28.93 
 
 		 528 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 559 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.89 
 
 		 516 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.82 
 
 		 505 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 535 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 498 aa  193  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 535 aa  193  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.1 
 
 		 539 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 544 aa  190  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.91 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.51 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.31 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 534 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 544 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 528 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  30.14 
 
 		 524 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.47 
 
 		 541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 551 aa  183  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  29.3 
 
 		 560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  29.57 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.49 
 
 		 535 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.62 
 
 		 535 aa  179  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  26.43 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  26.43 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  26.43 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.43 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.43 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.43 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  26.43 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 534 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 557 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.18 
 
 		 520 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 		 516 aa  177  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 		 534 aa  177  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 536 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.26 
 
 		 509 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  31.29 
 
 		 524 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1860  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 544 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.44883  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 516 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  28.82 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 528 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.11 
 
 		 529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 		 495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.4 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 527 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 535 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.62 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.45 
 
 		 531 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 501 aa  171  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  29.77 
 
 		 527 aa  171  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.62 
 
 		 526 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.62 
 
 		 526 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.62 
 
 		 526 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 517 aa  170  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 529 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 535 aa  170  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 549 aa  169  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.62 
 
 		 526 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 532 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4683  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 564 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.37 
 
 		 529 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 544 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 512 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.12 
 
 		 542 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.17 
 
 		 588 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>