More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1632 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  100 
 
 
247 aa  501  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  50.79 
 
 
253 aa  258  8e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  51.98 
 
 
253 aa  257  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  51.98 
 
 
253 aa  254  8e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  39.59 
 
 
249 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  37.2 
 
 
263 aa  168  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  36.4 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  35.1 
 
 
253 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  36.33 
 
 
237 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  34.54 
 
 
244 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  32.53 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  30.2 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  29.67 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.64 
 
 
247 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.69 
 
 
545 aa  89.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
261 aa  89.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 
562 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  34.38 
 
 
564 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  34.05 
 
 
254 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.61 
 
 
562 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.61 
 
 
562 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  31.79 
 
 
578 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  33.85 
 
 
561 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  29.19 
 
 
250 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.08 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.49 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.08 
 
 
561 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.08 
 
 
561 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.08 
 
 
561 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  28.23 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.06 
 
 
568 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.06 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.06 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.06 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.06 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.06 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.06 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.06 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.07 
 
 
581 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  27.03 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  31.02 
 
 
256 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  27.42 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  34.33 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  28.69 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  27.23 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  29.73 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  38.46 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  38.46 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  22.71 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  26.15 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  34.85 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  35.14 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.61 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  34.71 
 
 
630 aa  70.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  30.97 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  28.12 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  29.95 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  49.23 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  32.41 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  24.8 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  23.77 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  30.3 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
596 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  27.13 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  28.4 
 
 
590 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0970  Nucleotidyl transferase  34.65 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4511  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  40.45 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0533588  normal  0.0166086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1256  nucleotidyl transferase  36.46 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  47.62 
 
 
391 aa  65.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  25.98 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0072  nucleotidyl transferase  25.52 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.155346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  24.73 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  26.07 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  41.1 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  47.69 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  32.85 
 
 
364 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  39.62 
 
 
592 aa  64.7  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  23.79 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  24.19 
 
 
397 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  26.72 
 
 
393 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  46.15 
 
 
384 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  29.2 
 
 
331 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  44.44 
 
 
391 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  29.31 
 
 
331 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  32.12 
 
 
362 aa  63.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  35.04 
 
 
818 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  35.83 
 
 
776 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  31.48 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 
357 aa  62.8  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  24.8 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  31.91 
 
 
364 aa  62.4  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  28.22 
 
 
810 aa  62.4  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  32.28 
 
 
348 aa  62  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  22.13 
 
 
330 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  40.91 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1106  nucleotidyl transferase  29.05 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.59 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1690  nucleotidyl transferase  44.12 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  31.73 
 
 
355 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>