103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1630 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1630  hypothetical protein  100 
 
 		 754 aa  1516    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1417  hypothetical protein  48.59 
 
 		 779 aa  684    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.196003  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1751  hypothetical protein  48.59 
 
 		 779 aa  684    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0314  hypothetical protein  46.26 
 
 		 774 aa  620  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5512  hypothetical protein  40.75 
 
 		 771 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29441  hypothetical protein  42.14 
 
 		 693 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1022 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1404  hypothetical protein  34.31 
 
 		 990 aa  411  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.549738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0014  hypothetical protein  33.54 
 
 		 814 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3394  hypothetical protein  33.29 
 
 		 795 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0660  hypothetical protein  33.04 
 
 		 815 aa  347  6e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.81909 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7108  hypothetical protein  35.57 
 
 		 358 aa  227  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0728  hypothetical protein  32.75 
 
 		 389 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0729  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  32.69 
 
 		 396 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7106  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  29.84 
 
 		 414 aa  159  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.83 
 
 		 887 aa  58.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.36 
 
 		 821 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.88 
 
 		 867 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  24.11 
 
 		 842 aa  54.3  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  30.22 
 
 		 868 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  29.71 
 
 		 837 aa  53.9  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  39.19 
 
 		 971 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  40.3 
 
 		 907 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  29.86 
 
 		 868 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 793 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  28.41 
 
 		 869 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  40.3 
 
 		 873 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  30.28 
 
 		 869 aa  52  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  28.67 
 
 		 866 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  36.76 
 
 		 805 aa  51.2  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  28.47 
 
 		 868 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1575  hypothetical protein  34.21 
 
 		 610 aa  50.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270865  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  28.35 
 
 		 956 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.84 
 
 		 950 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.79 
 
 		 903 aa  50.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  29.17 
 
 		 868 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  29.58 
 
 		 868 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.49 
 
 		 971 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  28.47 
 
 		 868 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  28.47 
 
 		 868 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  24.46 
 
 		 874 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  29.17 
 
 		 868 aa  47.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.03 
 
 		 971 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.81 
 
 		 887 aa  48.1  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  29.35 
 
 		 911 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  39.06 
 
 		 592 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 804 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  34.62 
 
 		 794 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 800 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 800 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 800 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 798 aa  46.6  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  26.96 
 
 		 803 aa  46.6  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 800 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  28 
 
 		 814 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.33 
 
 		 891 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 		 870 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0954  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase,EI/HPr/EIIA components  36.36 
 
 		 955 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0821  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.36 
 
 		 956 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  29.73 
 
 		 799 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  24.03 
 
 		 821 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 799 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  30.14 
 
 		 793 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 799 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 800 aa  45.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2648  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  38.89 
 
 		 958 aa  45.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  35.29 
 
 		 812 aa  45.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 801 aa  45.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  30.88 
 
 		 837 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  34.21 
 
 		 758 aa  45.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  28.77 
 
 		 825 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  32.43 
 
 		 799 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  24.84 
 
 		 839 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  32.43 
 
 		 799 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  24.84 
 
 		 839 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3304  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  32.89 
 
 		 556 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 801 aa  44.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 797 aa  45.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  36.84 
 
 		 386 aa  44.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.78 
 
 		 830 aa  44.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 799 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 794 aa  44.3  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 799 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 799 aa  44.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 799 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 799 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 799 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 799 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  31.03 
 
 		 789 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 799 aa  44.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  29.49 
 
 		 778 aa  44.3  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  31.03 
 
 		 789 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 812 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  31.03 
 
 		 789 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 798 aa  44.3  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  31.03 
 
 		 789 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 794 aa  44.3  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 792 aa  44.3  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  30.88 
 
 		 792 aa  44.3  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  30.88 
 
 		 792 aa  44.3  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>