More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1571 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  68.87 
 
 
451 aa  654    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  68.65 
 
 
451 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  71.74 
 
 
453 aa  701    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  69.98 
 
 
451 aa  678    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  74.83 
 
 
452 aa  712    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  68.87 
 
 
451 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
453 aa  934    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  71.74 
 
 
453 aa  698    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  63.3 
 
 
455 aa  625  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  64.11 
 
 
457 aa  622  1e-177  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  45.45 
 
 
463 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  45.45 
 
 
463 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  45.23 
 
 
463 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  45.68 
 
 
482 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.68 
 
 
462 aa  434  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  45.23 
 
 
463 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  45.23 
 
 
463 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  44.57 
 
 
463 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  46.34 
 
 
464 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  46.56 
 
 
461 aa  425  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  46.12 
 
 
461 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  45.9 
 
 
464 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  45.9 
 
 
464 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  45.9 
 
 
464 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  46.12 
 
 
464 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  46.12 
 
 
464 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  45.9 
 
 
464 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  45.9 
 
 
464 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.58 
 
 
458 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  45.68 
 
 
470 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 
465 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 
483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 
481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 
472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  43.08 
 
 
481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 
483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.67 
 
 
469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  43.08 
 
 
483 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  43.08 
 
 
483 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  44.19 
 
 
460 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 
481 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  43.08 
 
 
483 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.11 
 
 
478 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  46.76 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  46.98 
 
 
446 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 
457 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 
457 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 
457 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 
457 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 
457 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  44.97 
 
 
446 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.01 
 
 
461 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  41.81 
 
 
456 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.79 
 
 
465 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 
457 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  45.86 
 
 
446 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 
457 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  45.25 
 
 
457 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  45.86 
 
 
446 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  46.09 
 
 
446 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.82 
 
 
456 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  46.09 
 
 
446 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  44.08 
 
 
473 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  45.41 
 
 
446 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.79 
 
 
465 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  45.86 
 
 
446 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  45.86 
 
 
446 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  43.88 
 
 
460 aa  391  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.37 
 
 
457 aa  390  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  43.23 
 
 
465 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 
457 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 
462 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.18 
 
 
460 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  45.86 
 
 
446 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  45.86 
 
 
446 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  44.87 
 
 
455 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  43.65 
 
 
463 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 
510 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  45.19 
 
 
463 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  44.74 
 
 
446 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  45.86 
 
 
446 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  43.79 
 
 
468 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  41.52 
 
 
458 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  44.37 
 
 
457 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  44.37 
 
 
457 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0053  coproporphyrinogen III oxidase  44.97 
 
 
446 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59946  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 
489 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 
460 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  43.49 
 
 
457 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  43.49 
 
 
457 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0090  coproporphyrinogen III oxidase  44.97 
 
 
446 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  43.49 
 
 
457 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  44.37 
 
 
457 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 
460 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  44.37 
 
 
457 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 
465 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  44.3 
 
 
456 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.37 
 
 
471 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  43.93 
 
 
457 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  41.23 
 
 
460 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>