More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1569 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1569  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
248 aa  494  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000273602  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0551  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.83 
 
 
261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.120124  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.71 
 
 
243 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.562052  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1219  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.71 
 
 
243 aa  216  4e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.751908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1094  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.71 
 
 
243 aa  214  8e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162529  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0958  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.61 
 
 
231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.764783  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1723  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.52 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000160405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0791  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.46 
 
 
252 aa  161  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.2 
 
 
247 aa  112  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.77 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.43 
 
 
255 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  29 
 
 
270 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.05 
 
 
255 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 
274 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
264 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.6 
 
 
266 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 
271 aa  105  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.37 
 
 
260 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  32.03 
 
 
289 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.18 
 
 
270 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
264 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.54 
 
 
264 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.32 
 
 
264 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.91 
 
 
260 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.24 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.47 
 
 
268 aa  99  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.55 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.2 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.24 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.81 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.89 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.79 
 
 
272 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.69 
 
 
280 aa  96.3  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.06 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.79 
 
 
272 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.6 
 
 
282 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.31 
 
 
266 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.28 
 
 
278 aa  95.9  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.55 
 
 
275 aa  95.5  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.31 
 
 
266 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.89 
 
 
276 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.89 
 
 
276 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.62 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  29.2 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0752  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.52 
 
 
303 aa  94  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.212702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.19 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.52 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.23 
 
 
263 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.3 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35750  delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.55 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.38 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.69 
 
 
274 aa  92.4  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.69 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.5 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.55 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.5 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.55 
 
 
272 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.08 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.1 
 
 
267 aa  92  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.55 
 
 
269 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.03 
 
 
272 aa  91.7  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.92 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.01 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.381317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.62 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.62 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.48 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.9 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.94 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.77 
 
 
267 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.63 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  30.27 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.31 
 
 
270 aa  89  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0240  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.28 
 
 
269 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.82 
 
 
274 aa  88.6  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.87 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0188  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  34.33 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0344  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.69 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.46 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.46 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.18 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.15 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.53 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.79 
 
 
269 aa  87  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.73 
 
 
272 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.03 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.44 
 
 
275 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 
276 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.92 
 
 
272 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3154  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.68 
 
 
154 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.369849 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.41 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>