More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1537 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
85 aa  171  2e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  95.24 
 
 
84 aa  164  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  95.24 
 
 
84 aa  164  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  95.24 
 
 
84 aa  164  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  92.94 
 
 
85 aa  163  8e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  94.12 
 
 
85 aa  163  9e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  94.05 
 
 
84 aa  162  1e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  89.41 
 
 
85 aa  154  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  84.52 
 
 
85 aa  144  4e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  77.65 
 
 
85 aa  135  3e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
85 aa  130  8e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.93871e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
84 aa  129  1e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97888e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
92 aa  129  2e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  129  2e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.90958e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 
85 aa  127  4e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.40306e-15  unclonable  7.87501e-24 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
85 aa  127  5e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
95 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
84 aa  124  4e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.53633e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 
89 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 
93 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
88 aa  121  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
94 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
84 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.60272e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
87 aa  119  1e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
87 aa  119  1e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
88 aa  119  2e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  65.48 
 
 
91 aa  117  8e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
98 aa  117  8e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.56783e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  71.26 
 
 
89 aa  116  1e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 
89 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 
91 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
95 aa  114  4e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.81623e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
90 aa  113  9e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
89 aa  112  1e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 
97 aa  112  2e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.33239e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
87 aa  112  2e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  1.09711e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
92 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
90 aa  111  4e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
93 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  63.86 
 
 
93 aa  110  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
91 aa  109  1e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 
90 aa  109  1e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
89 aa  109  1e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  109  1e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 
88 aa  109  1e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
89 aa  109  1e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
87 aa  109  1e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
89 aa  109  1e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 
89 aa  108  2e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
95 aa  108  2e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
89 aa  109  2e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
89 aa  108  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
89 aa  108  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
89 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  62.65 
 
 
95 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.69897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
89 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 
87 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  62.35 
 
 
86 aa  107  4e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
89 aa  107  4e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
85 aa  107  4e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
85 aa  107  4e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
85 aa  107  4e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  65.43 
 
 
84 aa  107  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  2.26179e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
84 aa  107  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
84 aa  107  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
91 aa  107  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  1.74741e-08 
 
 
-
 
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 
85 aa  107  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
85 aa  107  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
88 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
85 aa  107  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.91049e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  69.51 
 
 
85 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.26464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 
86 aa  106  8e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
85 aa  107  8e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  1.36289e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
86 aa  106  9e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
98 aa  106  9e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.63692e-08  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
90 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.11893e-12  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
88 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  60 
 
 
92 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  4.79005e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
88 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
88 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
100 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
100 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  2.71812e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
88 aa  105  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
86 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.34792e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 
103 aa  105  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.22269e-09  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
87 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
84 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  5.45576e-07  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  62.65 
 
 
87 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 
87 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
84 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
85 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
92 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
92 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  60 
 
 
143 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4327  50S ribosomal protein L27  60 
 
 
85 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  104  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>