More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1522 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1522  ExbDTolR family transport protein  100 
 
 
130 aa  259  6.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1741  ExbDTolR family transport protein  71.43 
 
 
132 aa  180  4.0000000000000006e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.490579  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0920  putative polysaccharide deacetylase  71.43 
 
 
132 aa  177  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0743675  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0690  ExbDTolR family transport protein  61.36 
 
 
132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00894494  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0518  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.94 
 
 
130 aa  147  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  52.42 
 
 
129 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  52.42 
 
 
129 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  51.61 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0198  TonB system transport protein ExbD  51.61 
 
 
128 aa  134  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00125254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1400  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.66 
 
 
130 aa  114  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.377979  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  37.19 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  35.54 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.67 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  34.71 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  34.71 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  34.71 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.19 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  36.07 
 
 
173 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  38.02 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  35.2 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  37.7 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  35.54 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  35.83 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.4 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  33.06 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  33.06 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  32.23 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.43 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  33.05 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  32.5 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  31.25 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  32.23 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.8 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  34.75 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  36.8 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  36.8 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  30.58 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  33.06 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  32.58 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  29.46 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  30.65 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  31.67 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  32.2 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  32.79 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.8 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.68 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.8 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  31.67 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  30.83 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  30.58 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  31.67 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  33.06 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  30.95 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.33 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.33 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1309  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.33 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.33 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.33 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  31.45 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.5 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  33.09 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  33.09 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  33.09 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  30.95 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  30.95 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  31.97 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  32 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  34.62 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  29.03 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>