34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1418 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  100 
 
 		 104 aa  209  7.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  77.88 
 
 		 104 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1235  cytochrome c553  64.04 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1602  cytochrome c553  61.45 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.330816  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  51.92 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  51.92 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  51.92 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  53.33 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  50.96 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  52.38 
 
 		 100 aa  97.4  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  40 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  36.05 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  27.71 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  28.97 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3126  cytochrome c class I  32.14 
 
 		 109 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549907 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 119 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  36.52 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  32.47 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  28.95 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  26.73 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  29.67 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  30.26 
 
 		 127 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>