17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1387 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 504 aa  981    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  50.4 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  49.6 
 
 		 505 aa  495  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  20.73 
 
 		 522 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  20.34 
 
 		 514 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 517 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  24.77 
 
 		 506 aa  93.6  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 		 519 aa  91.3  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  21.43 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  20.3 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3571  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 438 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 438 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0062  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 510 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0651262  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 501 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 586 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.32 
 
 		 499 aa  43.5  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>