More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1340 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1340  shikimate kinase  100 
 
 		 177 aa  343  8e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0052  shikimate kinase  64.85 
 
 		 170 aa  216  8.999999999999998e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  67.66 
 
 		 174 aa  216  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  66.06 
 
 		 173 aa  210  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1754  Shikimate kinase  57.74 
 
 		 184 aa  189  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0495  shikimate kinase  51.61 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0535  shikimate kinase  44.17 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0436  shikimate kinase  42.77 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1571  shikimate kinase  43.98 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0410  shikimate kinase  42.17 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  37.57 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  33.33 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  37.57 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  37.65 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  34.66 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  34.66 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  34.66 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  38.1 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  34.46 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  34.1 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  32.37 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  35.36 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  34.5 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  34.09 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  34.09 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  33.52 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  33.52 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  34.68 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  33.52 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  33.52 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  33.52 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  33.52 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  33.52 
 
 		 225 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  36.99 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  36.99 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  32.94 
 
 		 171 aa  91.7  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  33.52 
 
 		 225 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  33.52 
 
 		 225 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  33.71 
 
 		 172 aa  91.3  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  34.68 
 
 		 171 aa  91.3  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 173 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 173 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 173 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 173 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 173 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2022  shikimate kinase  35.84 
 
 		 192 aa  90.9  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  33.52 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  32.76 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  33.14 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  33.72 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  35.63 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  35.06 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  36.16 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  32.18 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  29.48 
 
 		 199 aa  88.2  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 171 aa  88.2  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 171 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 171 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 171 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 171 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  32.57 
 
 		 171 aa  87.8  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06600  shikimate kinase  31.82 
 
 		 188 aa  87.8  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 171 aa  87.8  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  32.95 
 
 		 171 aa  87.8  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  29.71 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  32.18 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01390  shikimate kinase  30.86 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  35.06 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  32.37 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  32.18 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  34.18 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  31.61 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  35.43 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  36.16 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  32.75 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  34.08 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  32.76 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  31.52 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  35.84 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  32.14 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  29.83 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  33.71 
 
 		 462 aa  85.1  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  33.33 
 
 		 229 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  33.91 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  30.51 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  30.51 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  29.83 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  34.48 
 
 		 198 aa  84.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  33.7 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  31.61 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  35.59 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  29.55 
 
 		 189 aa  84.3  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  36.16 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  34.66 
 
 		 165 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  35.59 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  34.46 
 
 		 174 aa  84.3  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  32.57 
 
 		 204 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  36.16 
 
 		 165 aa  84.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  30.99 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>