More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1203 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  100 
 
 
347 aa  697    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  34.49 
 
 
361 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  37.84 
 
 
367 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_27  iron ion ABC transporter, periplasmic component  25.42 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0380632  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  25.53 
 
 
397 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.17 
 
 
344 aa  99  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  23.56 
 
 
361 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  26.98 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  30.2 
 
 
377 aa  93.2  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  28.82 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  29.41 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  27.69 
 
 
351 aa  89.7  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  29.2 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  25.35 
 
 
682 aa  88.2  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  27.04 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.59 
 
 
386 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  25.5 
 
 
363 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  29.55 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  23.62 
 
 
348 aa  86.3  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  23.85 
 
 
349 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.63 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  24.65 
 
 
682 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.2 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.15 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
375 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  26.61 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  26.22 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.58 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.75 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  25.38 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2004  putative ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  26.17 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00731234  normal  0.178178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.9 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  23.31 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  28.73 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.77 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  22.76 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  23.37 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.4 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  23.55 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  23.83 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.72 
 
 
315 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3473  periplasmic binding protein  23.34 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  25.2 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  22.63 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  27.1 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  24.7 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  25 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  27.32 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  23.08 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.93 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  26.38 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  24.31 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3530  periplasmic binding protein  24.62 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.374472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  24.3 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  24.03 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  24.7 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  22.38 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  21.78 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  23.72 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  23.64 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  23.1 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1544  periplasmic binding protein  23.67 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  21.94 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  23.01 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  21.62 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  22.85 
 
 
350 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1479  iron(III) dicitrate-biding protein  24.8 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808536  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  22.85 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  23.64 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  23.08 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.66 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  22.85 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  22.36 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  23.05 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  22.85 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1713  periplasmic binding protein  23.26 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.917384  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  21.95 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  23.32 
 
 
299 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  22.73 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  21.04 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  22.71 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  22.71 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  23.85 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  25.26 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  24.12 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.78 
 
 
406 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  22.48 
 
 
352 aa  63.9  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.14 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  24.22 
 
 
318 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  25.26 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  23.32 
 
 
358 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  22.44 
 
 
369 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  23.31 
 
 
351 aa  63.2  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  24.14 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  22.42 
 
 
358 aa  63.2  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  27.23 
 
 
327 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  20.22 
 
 
296 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  22.53 
 
 
258 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  24.73 
 
 
335 aa  62.8  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>