More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1097 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
90 aa  176  5.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  84.44 
 
 
90 aa  151  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  83.33 
 
 
90 aa  150  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  81.11 
 
 
90 aa  147  5e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  82.22 
 
 
90 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  82.22 
 
 
90 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  82.22 
 
 
90 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0937  ribosomal protein S15  67.78 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1363  ribosomal protein S15  70 
 
 
90 aa  128  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0726  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 
91 aa  124  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000147654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 
89 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  61.36 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 
90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 
90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  53.41 
 
 
89 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2686  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
91 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  62.5 
 
 
87 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 
88 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  60.23 
 
 
89 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  103  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0816  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  103  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2817  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
91 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  60.71 
 
 
88 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
87 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
87 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3261  30S ribosomal protein S15  62.96 
 
 
88 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  60.71 
 
 
88 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  60.71 
 
 
88 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  56.82 
 
 
89 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
90 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
90 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  59.52 
 
 
88 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  59.52 
 
 
88 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 
88 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  53.93 
 
 
92 aa  100  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  100  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  100  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  60.49 
 
 
88 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  58.62 
 
 
90 aa  100  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  100  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  100  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  54.55 
 
 
89 aa  100  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1299  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  52.81 
 
 
95 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>