More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1082 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  100 
 
 
580 aa  1169    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  61.24 
 
 
487 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  60.82 
 
 
487 aa  598  1e-170  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  62.45 
 
 
476 aa  592  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0902  threonine synthase  59.04 
 
 
469 aa  559  1e-158  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0582732  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0833  threonine synthase  55.51 
 
 
470 aa  515  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159029  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1198  threonine synthase  55.09 
 
 
470 aa  514  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.823792  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0903  threonine synthase  55.09 
 
 
470 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  51.22 
 
 
498 aa  488  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  48.57 
 
 
490 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  46.52 
 
 
491 aa  452  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  38.11 
 
 
500 aa  314  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  38.19 
 
 
499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  38.93 
 
 
499 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000229411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  38.93 
 
 
493 aa  297  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000123828  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  38.7 
 
 
485 aa  296  5e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  37.5 
 
 
487 aa  295  2e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  37.78 
 
 
494 aa  294  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  33.68 
 
 
498 aa  290  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  37.19 
 
 
499 aa  290  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  36.72 
 
 
496 aa  288  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  38.65 
 
 
497 aa  287  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  34.34 
 
 
516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  34.68 
 
 
522 aa  283  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  36.3 
 
 
500 aa  282  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  36.4 
 
 
496 aa  281  3e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  34.64 
 
 
472 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  35.25 
 
 
499 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  36.88 
 
 
507 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  36.23 
 
 
467 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  34.03 
 
 
472 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  32.95 
 
 
472 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  34.44 
 
 
468 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  32.95 
 
 
472 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  33.04 
 
 
470 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  33.91 
 
 
469 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  32.41 
 
 
471 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  36.09 
 
 
495 aa  261  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000688351  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  34.25 
 
 
453 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  34.34 
 
 
469 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  32.95 
 
 
472 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  33.91 
 
 
469 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  34.23 
 
 
471 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  33.91 
 
 
469 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  33.56 
 
 
471 aa  259  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  33.62 
 
 
473 aa  259  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  34.33 
 
 
465 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  33.1 
 
 
476 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  34.4 
 
 
470 aa  256  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  34.62 
 
 
469 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  31.44 
 
 
461 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  34.43 
 
 
463 aa  254  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  33.69 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  34.43 
 
 
463 aa  253  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  37.32 
 
 
460 aa  253  6e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  32.23 
 
 
461 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  32.23 
 
 
461 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  34.89 
 
 
469 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  34.89 
 
 
469 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  33.1 
 
 
463 aa  253  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  34.19 
 
 
469 aa  251  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  33.79 
 
 
471 aa  250  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  32.6 
 
 
465 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  31.39 
 
 
462 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  34.43 
 
 
469 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  33.41 
 
 
504 aa  248  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  32.71 
 
 
470 aa  246  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  33.04 
 
 
494 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  34.33 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  33.26 
 
 
462 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  32.16 
 
 
471 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  32.71 
 
 
470 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  32.41 
 
 
470 aa  243  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  32.56 
 
 
463 aa  243  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  32.71 
 
 
470 aa  243  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  31.7 
 
 
461 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  33.26 
 
 
465 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  32.48 
 
 
462 aa  240  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  33.57 
 
 
461 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  32.87 
 
 
461 aa  239  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  31.92 
 
 
474 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  31.36 
 
 
502 aa  239  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  33.72 
 
 
467 aa  239  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  32.55 
 
 
460 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  35.12 
 
 
435 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  31.72 
 
 
465 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  28.51 
 
 
465 aa  238  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  33.97 
 
 
490 aa  238  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  0.000000294032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  33.96 
 
 
458 aa  236  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  34.35 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  33.02 
 
 
458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  30.7 
 
 
466 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  32.4 
 
 
466 aa  231  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  34.73 
 
 
496 aa  229  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  32.25 
 
 
463 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  34.15 
 
 
459 aa  228  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  34.25 
 
 
461 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  30.09 
 
 
465 aa  223  9e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  32.57 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  35.58 
 
 
476 aa  221  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.499285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>