186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1066 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  100 
 
 		 399 aa  790    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  59.76 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  59.76 
 
 		 418 aa  454  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  51.14 
 
 		 409 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  39.59 
 
 		 425 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  38.98 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  39.28 
 
 		 432 aa  275  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  40.24 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  39.47 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  38.46 
 
 		 420 aa  262  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  37.59 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  38.25 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  37.87 
 
 		 438 aa  255  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  37.87 
 
 		 438 aa  255  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  37.87 
 
 		 438 aa  255  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  37.87 
 
 		 438 aa  255  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  37.87 
 
 		 438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  37.62 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  36.63 
 
 		 412 aa  252  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  35.51 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  37.62 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  37.62 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  37.62 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  37.62 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  37.38 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  36.65 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  37.33 
 
 		 413 aa  239  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  35.97 
 
 		 434 aa  232  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  36.24 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  32.82 
 
 		 415 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  32.41 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  34.32 
 
 		 437 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  33.5 
 
 		 420 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  35.24 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  35.94 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  32.94 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  34.7 
 
 		 427 aa  217  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  33.68 
 
 		 389 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  34.16 
 
 		 424 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  33.09 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  33.09 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  33.09 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  33.09 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  30.92 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  32.84 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  33.09 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 415 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  33.75 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  36.14 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  31.14 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  33.09 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  33.49 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  34.66 
 
 		 468 aa  209  9e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  32.43 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  32.6 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  32.6 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  32.35 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  33.86 
 
 		 440 aa  206  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  32.01 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  30.65 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  32.11 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  32.11 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  31.41 
 
 		 436 aa  202  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  31.62 
 
 		 431 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4002  L-fucose:H+ symporter permease  31.34 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4123  L-fucose:H+ symporter permease  31.34 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4073  L-fucose:H+ symporter permease  31.34 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4018  L-fucose:H+ symporter permease  31.34 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4181  L-fucose:H+ symporter permease  31.34 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  31.39 
 
 		 435 aa  199  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  32.61 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  32.61 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  32.61 
 
 		 457 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  32.77 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  31.07 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  31.92 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05742  l-fucose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06730)  34.19 
 
 		 459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.227595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  32.2 
 
 		 428 aa  196  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  30.15 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  30.42 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  32.66 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  31.05 
 
 		 424 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  35.59 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  34.41 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  32.85 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  31.59 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0406  L-fucose transporter  28.74 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00228439  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58479  L-fucose permease Glucose/galactose transporter  34.53 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.851861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  29.03 
 
 		 485 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  32.99 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  32.99 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  30.79 
 
 		 436 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  29.96 
 
 		 471 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  32.49 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  31.75 
 
 		 474 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  34.58 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  31.39 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  32.2 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  31.51 
 
 		 429 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>