189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1028 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1028  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  200  5e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000970664  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  66.67 
 
 
69 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  66.67 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  65.22 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  63.77 
 
 
69 aa  92  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.67 
 
 
113 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  56.94 
 
 
112 aa  87  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4283  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.56 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.33 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.29 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  53.42 
 
 
113 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.56 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  56.52 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  56.52 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.39 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  52.78 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.39 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  53.33 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.43 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.78 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3090  putative alkylphosphonate uptake protein, phnA  53.73 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.62 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.78 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.62 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  40.21 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  52.86 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3817  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.73 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.88 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.88 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4739  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.62 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191551  normal  0.436041 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1254  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.7 
 
 
79 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0192046  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  51.43 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.35 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  52.86 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  52.86 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.72 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.35 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.57 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0904  PhnA-like protein  57.58 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000773889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  52.86 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  52.86 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0946  phnA protein  56.92 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000317474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0433  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.85 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.43 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.41 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.41 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.24 
 
 
113 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1791  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.24 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  50 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  50 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.24 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.24 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.24 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.24 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  54.41 
 
 
111 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.41 
 
 
111 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  54.41 
 
 
111 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  54.41 
 
 
111 aa  76.6  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.94 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.94 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  54.41 
 
 
111 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  54.41 
 
 
111 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  54.41 
 
 
111 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.43 
 
 
113 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  52.94 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  52.94 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.55 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  52.94 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  52.94 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  52.94 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1818  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.45 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942108  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2159  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.45 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  52.94 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3770  hypothetical protein  49.25 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.22 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.22 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  49.32 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  52.94 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.22 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.22 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  47.95 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  52.94 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  54.41 
 
 
73 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  53.85 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3334  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.94 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.85 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.85 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0976  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.94 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  53.73 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.7 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  56.72 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  52.94 
 
 
73 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  50 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.73 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>