221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1026 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1026  RmuC family protein  100 
 
 
435 aa  865    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000225596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  37.47 
 
 
428 aa  251  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  36.58 
 
 
626 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  32.43 
 
 
548 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  32.9 
 
 
427 aa  208  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0577  RmuC family protein  34.4 
 
 
397 aa  205  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.585058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2890  hypothetical protein  34.95 
 
 
437 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.18912  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  33.04 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0447  hypothetical protein  33.42 
 
 
437 aa  199  7e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0432711  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  32.81 
 
 
470 aa  197  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  31.91 
 
 
520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  35.2 
 
 
457 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  32.25 
 
 
510 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1623  putative alpha helix chain  31.72 
 
 
462 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.577151  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1474  DNA recombination protein RmuC  33.64 
 
 
446 aa  194  2e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  31.71 
 
 
510 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  31.65 
 
 
515 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  31.79 
 
 
506 aa  190  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  34.74 
 
 
519 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  34.74 
 
 
519 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  34.74 
 
 
519 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  34.74 
 
 
519 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  31.72 
 
 
513 aa  189  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  34.74 
 
 
518 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  30.27 
 
 
491 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  34.42 
 
 
518 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  35.06 
 
 
537 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  30.53 
 
 
480 aa  187  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  31.02 
 
 
453 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  34.74 
 
 
521 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  34.74 
 
 
521 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  34.74 
 
 
521 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  31.03 
 
 
492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  34.16 
 
 
498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  34.22 
 
 
522 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  31.39 
 
 
492 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  31.13 
 
 
495 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  32.17 
 
 
498 aa  182  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  31.53 
 
 
492 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  30.66 
 
 
495 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  30.66 
 
 
495 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  32.36 
 
 
491 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  26.4 
 
 
432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  30.39 
 
 
495 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  29.62 
 
 
494 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  31.03 
 
 
504 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  30.49 
 
 
453 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  27.27 
 
 
515 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  31.07 
 
 
491 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  28.03 
 
 
501 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  28.03 
 
 
501 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  28.03 
 
 
501 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  28.67 
 
 
424 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  28.17 
 
 
520 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  26.52 
 
 
500 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  29.22 
 
 
640 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  27.85 
 
 
420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  31.91 
 
 
518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  27.78 
 
 
518 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  27.88 
 
 
485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  30.33 
 
 
507 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2422  hypothetical protein  32.04 
 
 
639 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  30.6 
 
 
476 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  33.23 
 
 
448 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  28.81 
 
 
475 aa  169  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  28.81 
 
 
475 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  28.81 
 
 
475 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  28.81 
 
 
475 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  28.81 
 
 
475 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  31.29 
 
 
494 aa  169  1e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  28.81 
 
 
475 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  28.81 
 
 
475 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  28.81 
 
 
475 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  30.28 
 
 
476 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1094  hypothetical protein  28.82 
 
 
428 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437038  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  30.28 
 
 
476 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  28.36 
 
 
513 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  30.28 
 
 
476 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  28.86 
 
 
501 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  29.41 
 
 
527 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  30.28 
 
 
476 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  26.73 
 
 
475 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  30.45 
 
 
535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1370  protein of unknown function DUF195  26.25 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  27.25 
 
 
403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  29.29 
 
 
530 aa  162  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  30.23 
 
 
429 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1481  protein of unknown function DUF195  26.74 
 
 
435 aa  160  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0981784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1053  hypothetical protein  27.1 
 
 
437 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0125  RmuC domain-containing protein  31.29 
 
 
408 aa  160  5e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.63126  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  31.01 
 
 
510 aa  158  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  30.43 
 
 
630 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  28.07 
 
 
612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  26.04 
 
 
503 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  28.41 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  26.58 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1993  protein of unknown function DUF195  28.4 
 
 
479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  24.58 
 
 
448 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  26.35 
 
 
434 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  26.13 
 
 
417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.309141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>