More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1000 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  65.31 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  65.1 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  62.84 
 
 		 148 aa  179  8.000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  59.86 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  59.86 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  60.54 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  58.5 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  55.41 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  54.05 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  37.84 
 
 		 150 aa  97.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 168 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  31.51 
 
 		 152 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 148 aa  95.9  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 154 aa  95.9  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 151 aa  94.4  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  36.55 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  36.99 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  42.66 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  36.67 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  91.3  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 171 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  34.23 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1355  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 152 aa  90.1  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 167 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  36.77 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  36.55 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  34.03 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  33.33 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  35.76 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  38.26 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  30.14 
 
 		 152 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  30.14 
 
 		 152 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  35.76 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  36.91 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  38 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  36.03 
 
 		 191 aa  85.5  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0789  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  30.34 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>