More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0980 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0980  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
374 aa  780    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1172  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.44 
 
 
372 aa  629  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0093  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.59 
 
 
376 aa  628  1e-179  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0899534  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0584  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.63 
 
 
373 aa  627  1e-178  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0414152  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1432  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.98 
 
 
388 aa  616  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0681966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1267  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.31 
 
 
373 aa  587  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1028  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.54 
 
 
373 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1090  queuine tRNA-ribosyltransferase  75 
 
 
373 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.50041  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0779  queuine tRNA-ribosyltransferase  75 
 
 
373 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113002  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.52 
 
 
372 aa  531  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.38 
 
 
379 aa  403  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.94 
 
 
370 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
373 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.9 
 
 
371 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
375 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.63 
 
 
407 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 
372 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 
377 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
386 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.74 
 
 
373 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
370 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.01 
 
 
373 aa  378  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 
373 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 
372 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
355 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.15 
 
 
392 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 
371 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 
374 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
372 aa  371  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
375 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 
367 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2394  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.4 
 
 
367 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.92 
 
 
379 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
380 aa  364  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.96 
 
 
374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
371 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.63 
 
 
383 aa  360  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
381 aa  359  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.63 
 
 
383 aa  359  6e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.35 
 
 
373 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.13 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.22 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.2 
 
 
376 aa  355  5e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.31 
 
 
374 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
377 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.54 
 
 
379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.61 
 
 
371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.61 
 
 
371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
379 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
379 aa  352  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
379 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
379 aa  352  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
379 aa  352  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
379 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
379 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
379 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
379 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.65 
 
 
394 aa  352  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.81 
 
 
379 aa  352  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.74 
 
 
376 aa  352  5.9999999999999994e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.38 
 
 
385 aa  351  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.94 
 
 
370 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.92 
 
 
377 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.8 
 
 
376 aa  351  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.65 
 
 
380 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.74 
 
 
376 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.01 
 
 
392 aa  349  6e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0084  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
384 aa  349  6e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000052368  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.51 
 
 
382 aa  348  7e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.04 
 
 
374 aa  348  8e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.74 
 
 
392 aa  348  9e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.69 
 
 
379 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  46.36 
 
 
371 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.05 
 
 
372 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.69 
 
 
379 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.92 
 
 
377 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.47 
 
 
392 aa  347  3e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.92 
 
 
377 aa  345  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.77 
 
 
376 aa  346  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.65 
 
 
371 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.24 
 
 
374 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.5 
 
 
384 aa  345  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40480  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 
371 aa  345  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.38 
 
 
371 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.38 
 
 
377 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.38 
 
 
377 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.53 
 
 
368 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.11 
 
 
369 aa  343  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.38 
 
 
372 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.23 
 
 
395 aa  343  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.09 
 
 
369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.61 
 
 
384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.82 
 
 
375 aa  343  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
375 aa  343  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
375 aa  343  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
375 aa  343  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 
375 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
375 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.9 
 
 
369 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
375 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>