227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0972 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  772    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  76.6 
 
 		 376 aa  614  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  79.1 
 
 		 335 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  66.49 
 
 		 376 aa  544  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  65.69 
 
 		 375 aa  523  1e-147  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  55.29 
 
 		 378 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  27.87 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27.35 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.35 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  28.7 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.05 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  28.1 
 
 		 350 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.19 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  28.35 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.82 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  25.37 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  25.89 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  26.9 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.43 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  27.84 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  25.6 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.77 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.66 
 
 		 334 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  25.66 
 
 		 334 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  27.3 
 
 		 346 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  25.14 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  26.28 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.99 
 
 		 330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25.08 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.58 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.15 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.25 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.47 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.07 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  22.02 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.14 
 
 		 346 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.15 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  25.66 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  24.7 
 
 		 362 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  24.38 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.71 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  24.38 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.92 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  22.51 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  22.22 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  24.12 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  24.93 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  22.22 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  23.78 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.32 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.01 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.01 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  29.7 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  25.93 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.19 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  25.34 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  24.46 
 
 		 352 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  25.23 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  25.52 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  26.47 
 
 		 346 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  26.47 
 
 		 346 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  24.1 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.6 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  22.73 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  22.94 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  24.21 
 
 		 339 aa  91.3  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  22.75 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  25.68 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.06 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  20.41 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  26.38 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  26.38 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  26.38 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  26.38 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  26.38 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  26.38 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  26.38 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  26.38 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  26.38 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  24.26 
 
 		 568 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  24.29 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  21.59 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  22.03 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  24.02 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  24.59 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  26.06 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  23.77 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  20.87 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  22.79 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  22.05 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  24.14 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  24.62 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  24.14 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  19.4 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  23.55 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  23.55 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  23.55 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  22.18 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>