More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0960 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  100 
 
 
261 aa  529  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  37.7 
 
 
253 aa  178  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  30.88 
 
 
239 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  28.36 
 
 
240 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  31.82 
 
 
242 aa  100  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  30.39 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  28.34 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2071  hypothetical protein  30.86 
 
 
144 aa  95.1  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  32.26 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  33.16 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  36.36 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  24.05 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  29.07 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  34.45 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  32.14 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  28.99 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.91 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  25.71 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  28.05 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  28.18 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.66 
 
 
275 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  28.93 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  32.14 
 
 
257 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  29.13 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  40.51 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  38.03 
 
 
247 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  28.85 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  30.08 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  30.69 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  36 
 
 
217 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  34.55 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.9 
 
 
352 aa  54.3  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  34.41 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  28.24 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  46.67 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  27.34 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.1 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 
298 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  30.17 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.33 
 
 
434 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 
232 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  32.67 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  32.67 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  32.67 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  29.57 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  33.71 
 
 
286 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  48.89 
 
 
294 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  23.12 
 
 
278 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  32.67 
 
 
249 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
210 aa  52.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  32.67 
 
 
249 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  23.12 
 
 
278 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  23.12 
 
 
278 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  31.25 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 
266 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 
234 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  28 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  23.65 
 
 
323 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  31.68 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.77 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  26.26 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  26.27 
 
 
270 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  32.05 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  25 
 
 
581 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  50 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  31.68 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  50 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  35.21 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  36.63 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  31.37 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.52 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0957  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.47 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  43.75 
 
 
273 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  43.14 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.95 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
210 aa  50.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>